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(無題) 削除/引用 No.889-2 - 2009/07/21 (火) 11:20:54 - めい これまで見つかってない新規のドメインであれば当然DBに登録はされていないのでどのエンジンを使っても出てこないとおもいますが（笑）。 既知のドメインをすべて取ってから残った部分で解析というのであればInterProで全部検出すればいいと思います。 http://www.ebi.ac.uk/interpro/ あと、いいかげんと言うのは結局どのタンパク質にでも適用できるように検索エンジンは相同性の数値で切ってしまっているので厳密にやるのであればファミリー遺伝子を含めた一次、二次構造情報を先に調べるのがいいと思います。

ドメイン解析ソフト 削除/引用 No.889-1 - 2009/07/20 (月) 02:30:39 - にこ さまざまなソフトがありますが、 どのドメイン解析ソフトが一番いいのでしょうか。 これまでに見つかっていない新規のドメインを探索しているので、 ncbiやsmartより pfamがいい感じを受けているのですが、 逆に若干いい加減な感じも受けます。 皆さんのオススメは何でしょうか。 ncbiのccdやsmartはメジャーなものしか表示がされない気もします。

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