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系統樹の作成
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No.885-TOPIC - 2009/07/18 (土) 23:46:45 - けい
論文を投稿する予定です
系統樹をソフトを使って描いたのですが
有名な雑誌にあるような華やかさがありません
あれは自分でイラストレーターで書く物なのでしょうか?
またドメイン解析はWeb上の解析ソフトの図をコピーしてもいいんでしょうか?
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No.885-4 - 2009/07/19 (日) 23:26:42 - Ercolania
クレード別に色分けされた系統樹などを想定されているのでしょうか?
私はPAUPなどで出力された系統樹をイラストレーターで再編集しています
それが結局は一番早いと思います。
MacではFigTreeというフリーソフトが、クレード別の色分けやpdf形式での書き出しに対応していて便利です。
http://tree.bio.ed.ac.uk/software/figtree/
windowsならMEGAの系統樹編集機能は結構リッチで便利です。
http://evolgen.biol.metro-u.ac.jp/MEGA/
私の作業の流れとしては、
1、PAUPで.treファイルを作成
2,FigTreeで適切なルートの選択や、議論に適した形にクレードの順番を変更を行う
3,pdfで出力してイラストレータで最終編集(色付け、ブートストラップ値の表記)
です。
(無題)
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No.885-2 - 2009/07/19 (日) 12:19:49 - natu
ウェブツールの「Clustal W」とフリーウェアの「Tree view」で
描いてる論文は結構多いよ。
系統樹の作成
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No.885-1 - 2009/07/18 (土) 23:46:45 - けい
論文を投稿する予定です
系統樹をソフトを使って描いたのですが
有名な雑誌にあるような華やかさがありません
あれは自分でイラストレーターで書く物なのでしょうか?
またドメイン解析はWeb上の解析ソフトの図をコピーしてもいいんでしょうか?
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