BioTechnicalフォーラム [データベースの利用]

データベースの利用

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No.711-TOPIC - 2009/06/20 (土) 11:55:17 - ken

なんでもいいから、
疾患関連遺伝子をデータベースを元に同定するテーマを言い渡されたのですが、
データベースだけで同定することは可能なのでしょうか？
　

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No.711-8 - 2009/06/23 (火) 05:05:54 - けろろ

＞ばいやさん

なるほど、確かにそうですね。
こういうサイトで尋ねるというのも、方法のひとつかもしれませんね。

＞ken さん

NCBI の GEP profiles なんてどうでしょう？
このデータベースでは、患者と健常者を GeneChip で比較して、発現量に差がある遺伝子群のデータなどもよく up されてます。

ご返信ありがとうございます。

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No.711-7 - 2009/06/23 (火) 03:25:56 - ken

実はいろいろ下調べをしてみたのですが、

情報が公開されている＝すでに解析済み

になっていることが多く、
臨床データがあっても見ることができるだけで、
何の意味もないことが多いという感触を抱きました。

HAPMAPとかを使えばいいんですかねぇ？
よくわかりません。。。

あと私に与えられたテーマは疾患の責任遺伝子です。
でも発現量とかも面白そうですね。
やられた方いますか？

(無題)

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No.711-6 - 2009/06/22 (月) 09:38:31 - 中年

疾患関連遺伝子の「関連」が何を指すかによって方法は違ってきます。

特定の疾患で発現に変動が見られる遺伝子？
遺伝性疾患の責任遺伝子や修飾遺伝子？

(無題)

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No.711-5 - 2009/06/22 (月) 09:09:43 - ばいや

>[Re:4] けろろさんは書きました :
> やれるかどうかより、やり方を訊いた方が良いであります。

学生さんならそのやり方を熟考するのが方針かもしれません。
また分野は絞られているけど、詳しくまで分からないようでテーマを与えている気がするので、その絞込みのアドバイスをしたほうがいいかも。

(無題)

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No.711-4 - 2009/06/21 (日) 08:10:32 - けろろ

やれるかどうかより、やり方を訊いた方が良いであります。