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RNAiの発現ベクター トピック削除
No.664-TOPIC - 2009/06/16 (火) 08:09:44 - mugimaki
いつも貴重な情報を参照させて頂いております.
RNAiの発現ベクターについて情報をお持ちの方がいらっしゃいましたら
お教え頂けると幸いです.

レトロウイルスなどのウイルスベクターを用いてsiRNAまたはshRNAの発現ベクターの
構築を考えております.色々これらのベクターの違いについて検索しているのですが,
どちらがknockdown効果が高いのか,どちらがいいのかなどといった情報が探せずにいます.

配列に依存するのでなんとも言えないとは思うのですが,こういった情報をお持ちの方や
実際構築してみてこちらの方が楽だった,こちらはオフターゲット効果が出やすいなどの
情報・論文等をお教え頂けると幸いです.

各社から色々な製品が出ているようでmiRNAに近いものもあるみたいですが,実際の所
どうなんでしょうね.

また
実験系によってはこれを使用しなければならないとかもありましたらご教授下さい.
自分の理解ではdicerがない細胞(居るんでしょうか)ではshRNAは働かないですよね.

宜しくお願いいたします.
 
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(無題) 削除/引用
No.664-2 - 2009/06/16 (火) 08:29:38 - 〜
決してsigmaの回し者ではありませんが、お金に余裕があるならば、mission shRNAはそれなりにいいと思います。
ただレトロではなくレンチになってしまいますが。
1つの遺伝子につき4−5個セットなのですが、かならず2つくらいはよく効くものがあります。
自分でshRNAベクターを構築する手間ひまを考えると、コストパフォーマンスもそれほど悪くはないのでは。
miRNAは一度試したことがありますが、shRNAより優れているという印象はありませんでした(つぶす遺伝子にもよるとは思いますが)。

RNAiの発現ベクター 削除/引用
No.664-1 - 2009/06/16 (火) 08:09:44 - mugimaki
いつも貴重な情報を参照させて頂いております.
RNAiの発現ベクターについて情報をお持ちの方がいらっしゃいましたら
お教え頂けると幸いです.

レトロウイルスなどのウイルスベクターを用いてsiRNAまたはshRNAの発現ベクターの
構築を考えております.色々これらのベクターの違いについて検索しているのですが,
どちらがknockdown効果が高いのか,どちらがいいのかなどといった情報が探せずにいます.

配列に依存するのでなんとも言えないとは思うのですが,こういった情報をお持ちの方や
実際構築してみてこちらの方が楽だった,こちらはオフターゲット効果が出やすいなどの
情報・論文等をお教え頂けると幸いです.

各社から色々な製品が出ているようでmiRNAに近いものもあるみたいですが,実際の所
どうなんでしょうね.

また
実験系によってはこれを使用しなければならないとかもありましたらご教授下さい.
自分の理解ではdicerがない細胞(居るんでしょうか)ではshRNAは働かないですよね.

宜しくお願いいたします.

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