Bio Technical フォーラム

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シークエンスについて トピック削除
No.611-TOPIC - 2009/06/04 (木) 15:09:58 - wt
 遺伝子解析は、初心者のためよくわからないことがあります。
 
現在、Sequencherというソフトを使ってシークエンスを行っています。

しかし、疑問点が出てきました。大腸菌に組み込んだDNAを、いくつかのプライ

マーを使って配列を解析する時に、5'→3'側と3'→5'側のプライマーではAとT、

CとGが逆だと思うのですが?

これは、配列の重複位置から向きなどを判断して、自動的に変換してくれている

と考えていいのでしょうか?

また、もしそうならば重複がない場合はアライメントを行うことはできないの

でしょうか?

くだらないことなんですが、気になったため わかる方がいたらご教授頂きた

いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.611-2 - 2009/06/04 (木) 15:19:13 - 中年
> これは、配列の重複位置から向きなどを判断して、自動的に変換してくれている
>
> と考えていいのでしょうか?

そうです。

それから、新しい機器やソフトウェアを使う場合にはマニュアルを読むようにした方が良いですよ。

シークエンスについて 削除/引用
No.611-1 - 2009/06/04 (木) 15:09:58 - wt
 遺伝子解析は、初心者のためよくわからないことがあります。
 
現在、Sequencherというソフトを使ってシークエンスを行っています。

しかし、疑問点が出てきました。大腸菌に組み込んだDNAを、いくつかのプライ

マーを使って配列を解析する時に、5'→3'側と3'→5'側のプライマーではAとT、

CとGが逆だと思うのですが?

これは、配列の重複位置から向きなどを判断して、自動的に変換してくれている

と考えていいのでしょうか?

また、もしそうならば重複がない場合はアライメントを行うことはできないの

でしょうか?

くだらないことなんですが、気になったため わかる方がいたらご教授頂きた

いです。

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