Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

IRESベクターへの挿入法 トピック削除
No.543-TOPIC - 2009/05/23 (土) 13:58:09 - gico
IRESについていろいろな文献を見てみましたが、今ひとつはっきりと
しないのでどなたか経験をお持ちの方、教えていただけないでしょうか。

ひとつは、IRESの後ろに目的遺伝子を挿入する場合にIRES中のATGと目的遺伝子の
フレームは合わせた方が良いのでしょうか?
何番目のATGと合わせた方が良いという論文もあれば、コマーシャルに入手できる
ベクターでもあまりこの点は重視されていない気もします。

もう一つは、IRESと目的遺伝子の間に余分な配列が入った場合の影響はどれくらい
考えておいた方が良いでしょうか?
もちろんほとんど余分な配列を入れずに目的遺伝子を挿入することは可能ですが、
もし単に他のexpression vectorからのフラグメントを挿入した場合に、フラグメントに
含まれる5'UTRやbackboneベクターの一部が入った場合IRESからの発現は得られる
のでしょうか。
例えば40-50bpの余分な配列がIRESと目的遺伝子の間に存在する場合などはどうでしょうか?

ご自分でIRES発現ベクターを作製された経験をお持ちの方がおられましたら
よろしくお願いします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.543-2 - 2009/05/23 (土) 14:56:09 - ats
IRESの本来のATGと目的遺伝子のATGの距離が離れる(この場合ATGは変異させておく)とIRES の翻訳開始効果が減少します。論文があったと思います。
市販されているものは、IRES前の目的遺伝子発現が大きい安定導入株が得られるようにわざとIRESと薬剤耐性遺伝子を離しているようです。

IRESベクターへの挿入法 削除/引用
No.543-1 - 2009/05/23 (土) 13:58:09 - gico
IRESについていろいろな文献を見てみましたが、今ひとつはっきりと
しないのでどなたか経験をお持ちの方、教えていただけないでしょうか。

ひとつは、IRESの後ろに目的遺伝子を挿入する場合にIRES中のATGと目的遺伝子の
フレームは合わせた方が良いのでしょうか?
何番目のATGと合わせた方が良いという論文もあれば、コマーシャルに入手できる
ベクターでもあまりこの点は重視されていない気もします。

もう一つは、IRESと目的遺伝子の間に余分な配列が入った場合の影響はどれくらい
考えておいた方が良いでしょうか?
もちろんほとんど余分な配列を入れずに目的遺伝子を挿入することは可能ですが、
もし単に他のexpression vectorからのフラグメントを挿入した場合に、フラグメントに
含まれる5'UTRやbackboneベクターの一部が入った場合IRESからの発現は得られる
のでしょうか。
例えば40-50bpの余分な配列がIRESと目的遺伝子の間に存在する場合などはどうでしょうか?

ご自分でIRES発現ベクターを作製された経験をお持ちの方がおられましたら
よろしくお願いします。

2件 ( 1 〜 2 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を