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(無題) 削除/引用 No.446-6 - 2009/06/12 (金) 00:55:08 - T http://chalk-less.org/lecture/lifesci/bioinfo/MultiSeqAlign/MultiSeqAlign.html ここは？

ありがとうございます 削除/引用 No.446-5 - 2009/05/12 (火) 11:21:18 - mimi あべちゃんさん、おおさん、書き込み有難うございます。 アミノ酸のidentityとsimilarityは、違うものと取りあえずは認識しています。完全にアミノ酸が一致している比率？みたいなのがidentityで、アミノ酸の性質とかも考慮してあるのが、similarityって聞いたことがあります。 トピの内容は、identityと書いちゃいましたが、どちらも比較解析できるサイトがあれば、嬉しいところです。 再びお願いします。

(無題) 削除/引用 No.446-4 - 2009/05/12 (火) 11:07:23 - あべちゃん トピ主さんすみません。 ちょっとそれますが、 相同性identityと類似性similarityは、意味が異なりますよね。自信ないですが、アミノ酸残基が、ばっちりマッチした率を相同性、荷電や酸･塩基性などを含めたものを類似性？ 違いますか？どなたかご存じないですか？

(無題) 削除/引用 No.446-3 - 2009/05/12 (火) 10:48:17 - おお http://www.kenkyuu.net/megalink.html 研究留学ネットのリンクからでもさがせます。 局所でやるか、グローバルでやるかとか、両方でやってもっともらしいところを 引っ張ってきて合わせるかで違った結果になることがあると思います。

(無題) 削除/引用 No.446-2 - 2009/05/12 (火) 10:43:28 - あべちゃん http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=megaBlast&SHOW_DEFAULTS=on&BLAST_SPEC=blast2seq&LINK_LOC=align2seq や http://www.ebi.ac.uk/Tools/clustalw2/index.html など

アミノ酸配列の類似性の出し方 削除/引用 No.446-1 - 2009/05/12 (火) 09:41:51 - mimi 　タンパク質Aとタンパク質Bの相同性（identity）をネット上のサイトで調べることはできるのでしょうか？ 　ご存知の方がいらっしゃれば、お教え下さい。

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