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遺伝子配列解析ソフト トピック削除
No.391-TOPIC - 2009/04/24 (金) 13:49:01 - wataru
 現在、発現ベクター作成のため、インサートを導入し、その配列を解析

・確認しようと思っています。しかし、遺伝子解析ソフトがいまいち使用方

法がわかりません。ソフトは、bio editを使っているのですが、使い方を教

えて頂きたい、あるいは使い方が UP されているサイトはないでしょうか?

他の、スレを探して私が知りたい情報が載っていなかったので 今回スレを

立ち上げました。
 
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(無題) 削除/引用
No.391-3 - 2009/04/24 (金) 15:42:06 - IRES
New Alignmentを押して新しいフィールドを作ります。
Sequence>New sequenceをおしてでてくるダイアログに目的遺伝子の配列、配列名、Sequence typeをDNAにしてApply and clloseを押します。
同様にNew sequenceでプラスミドのDNA解析結果を同じフィールドに入れます。
フィールド上にある配列の名前を両方選択します。
Accesorry Application>ClustalW...を選択します。
アイアログがでてくるのでそのままOKを押します。
新しいフィールド上に選択した配列のアライメントが表示されます。

それ以外の使い方は入力した配列で遊びながら学んでください。

ちなみに基本的な使い方はGoogleで検索すると日本語のHPが引っかかってくるはずですよ。

(無題) 削除/引用
No.391-2 - 2009/04/24 (金) 14:40:47 - ~
http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/BioEditTutorial.html
元のベクターの配列と、入れたはずのインサート配列と、読んだ配列を並べて、
予定通りの位置に入っているかを見ることが出来ます。
ホモロジー検索も出来るそうです。(やったことはありませんが)

個人的には、1行の文字数制限が無いテキストエディタを使う方がやりやすいです。

遺伝子配列解析ソフト 削除/引用
No.391-1 - 2009/04/24 (金) 13:49:01 - wataru
 現在、発現ベクター作成のため、インサートを導入し、その配列を解析

・確認しようと思っています。しかし、遺伝子解析ソフトがいまいち使用方

法がわかりません。ソフトは、bio editを使っているのですが、使い方を教

えて頂きたい、あるいは使い方が UP されているサイトはないでしょうか?

他の、スレを探して私が知りたい情報が載っていなかったので 今回スレを

立ち上げました。

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