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マウスとヒトのMHC トピック削除
No.3867-TOPIC - 2011/01/22 (土) 06:50:19 - 310
ヒトのHLA-Cと関連するマウスのH2は何だろう？と思いPubMedで調べていますが、いい文献が見つかりません。WebではWikipediaに

>古典的クラスI分子には、ヒトではHLA-A、HLA-B、HLA-Cの3種類が、マウスで>はH-2K、H-2D、H-2Lの3種類がある。

と書いてありますが、どれがどうと言う関連は書いてありませんでした。

ヒトのHLA-CのcDNAをBLASTすると、H-2KおよびH-2Lは82%、H-2Dが84％と差が見られませんでした。

分かる方には初歩的で申し訳ありませんが、ヒトのHLA-A、HLA-B、HLA-CがマウスではH-2K、H-2D、H-2Lのどれに該当するか、あるいはどれにも該当しないか、教えてください。
　
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(無題) 削除/引用
No.3867-11 - 2011/01/30 (日) 14:53:29 - な
> 違う･･･(汗)

えっ？　こちらのamiさんはマウスの脾臓のつぶし方を語っていたamiさん？
では、ご専攻はなんなんですか？興味本位な質問ですが・・・

(無題) 削除/引用
No.3867-9 - 2011/01/30 (日) 14:38:03 - ami
> ちなみに、amiさん（少なくとも一人のamiさん）も過去のレスから明らかに免疫を専攻している方と思われます。

違う･･･(汗)

> 答えは、文献からではありません。NCBIのHomoloGeneを用いて検索した結果です。

(A) アミノ酸配列のホモロジーがあること

(B) 機能的な関連が認められないこと(ある抗原が、マウスではどのMHC、ヒトではどのMHCで提示されるか、ということに関して、まったく対応はつかないこと)

(A)(B)の、どちらが根拠として強いと考えるか、という問題です。機能的な関連が認められる文献があったら知りたいな、と思ったのですが。

ホモロジーを元に、どれとどれが対応する、と言っても間違いではないと思いますが、機能が対応してないと思うので、言っても意味のないことだと思います。

(無題) 削除/引用
No.3867-8 - 2011/01/30 (日) 09:58:56 - な
ホモロジーがどうであれ、免疫学で20年やってきていますが実際にマウスのMHCと人のMHCを、免疫応答の類似性に関して論じている話を聞いたことがありません。機能的には対応する関係を示す根拠は、あってとしてもごくわずかで、それが統一見解になっているとはとても思えません。

ちなみに、amiさん（少なくとも一人のamiさん）も過去のレスから明らかに免疫を専攻している方と思われます。

(無題) 削除/引用
No.3867-7 - 2011/01/30 (日) 08:36:23 - 長崎の田舎者
「amiさんが、なぜこのように発言されたのか、その根拠はなんだったのかをまずは述べるべきかなと」という「HLA user」さんの質問にamiさんのレスポンスがあるまで待とうと思いましたが、まったく反応ありませんので、「ami」さんの質問に答えます。

答えは、文献からではありません。NCBIのHomoloGeneを用いて検索した結果です。

(無題) 削除/引用
No.3867-6 - 2011/01/25 (火) 21:14:21 - HLA user
>どれにも該当しない、に１票

なぜこのように発言されたのか、その根拠はなんだったのかをまずは述べるべきかなと。

横から質問すいません 削除/引用
No.3867-5 - 2011/01/25 (火) 20:27:14 - ami
>[Re:4] 長崎の田舎者さんは書きました :
> マウスclass Iは、
> HLA-A　→　H2-Q10
> HLA-B　→　H2-Q1, Q2, Q6, Q7
> HLA-C　→　H2-K1, D1
> のようです。
> （H2-Lがどこに当たるか不明です。）
>
> ちなみに、class IIは、
>
> HLA-DQA1　→　H2-Aa
> HLA-DQB1　→　H2-Ab1
> HLA-DRB1　→　H2-Eb1
> です。

これの文献教えていただきたいです。横からすいません。

(無題) 削除/引用
No.3867-4 - 2011/01/25 (火) 18:45:10 - 長崎の田舎者
マウスclass Iは、
HLA-A　→　H2-Q10
HLA-B　→　H2-Q1, Q2, Q6, Q7
HLA-C　→　H2-K1, D1
のようです。
（H2-Lがどこに当たるか不明です。）

ちなみに、class IIは、

HLA-DQA1　→　H2-Aa
HLA-DQB1　→　H2-Ab1
HLA-DRB1　→　H2-Eb1
です。

(無題) 削除/引用
No.3867-3 - 2011/01/22 (土) 19:50:55 - balb
各々のMHCのホモロジーを検討してみては如何ですか？
配列の比較だけなら比較的簡単に出来る気がします。

(無題) 削除/引用
No.3867-2 - 2011/01/22 (土) 10:57:40 - ami
どれにも該当しない、に１票

マウスとヒトのMHC 削除/引用
No.3867-1 - 2011/01/22 (土) 06:50:19 - 310
ヒトのHLA-Cと関連するマウスのH2は何だろう？と思いPubMedで調べていますが、いい文献が見つかりません。WebではWikipediaに

>古典的クラスI分子には、ヒトではHLA-A、HLA-B、HLA-Cの3種類が、マウスで>はH-2K、H-2D、H-2Lの3種類がある。

と書いてありますが、どれがどうと言う関連は書いてありませんでした。

ヒトのHLA-CのcDNAをBLASTすると、H-2KおよびH-2Lは82%、H-2Dが84％と差が見られませんでした。

分かる方には初歩的で申し訳ありませんが、ヒトのHLA-A、HLA-B、HLA-CがマウスではH-2K、H-2D、H-2Lのどれに該当するか、あるいはどれにも該当しないか、教えてください。
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