寝言なので、あまり深く関わっていただくと申し訳ないですが...
「標準配列」は、resequence で使う、基準にする配列です。
マウスだと、RPCI-23 BAC RPCI-24 BAC の C57BL/6J という系統の配列を使いますが、ヒトの場合は、系統っていうのが無いので、でもどれかを基準にしないとものは言えないし、と、考え、基準にしている配列って、どういう性状のモノかな?と思った次第です。
>いまの配列情報はがん細胞だけでなく、健常人からの血液やプライマリーカルチャーとか色々な配列情報から成り立っています
がん細胞が結構な割合で入っていれば、その情報で「再構築」したヒトの姿はがんだらけとは言わずとも、結構ハイリスクなヒトだろうし、まぜこぜで癌リスクのある遺伝子変異が消去されているなら、これまた「再構築」したヒトの姿はどんな感じだろうかと。
自分が使っているプロモーターレポーターとかcDNA 発現ベクターが、塩基配列データベースとまったく一緒ではないときがありますが、
「これって何を調べてるんだっけ?」
という自問自答も、この寝言の深層心理かもしれません。 |
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