Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

冬休みの寝言 ゲノム情報から再構築したヒトは健常人? トピック削除
No.3752-TOPIC - 2010/12/30 (木) 11:21:19 - Actias
ヒトゲノム、というのをぼんやり考えていました。

昔のクローン解析の寄せ集め時代から、高速シーケンサーの時代に移り、たくさんの配列情報が出てくるようになりました。
それでふと、リシーケンスで使う”標準配列”がどういうモノ由来だろうか、と考えました。

当然、DNAを抽出しやすいサンプル由来だろうな、と思います。
それなら培養細胞は入っているんだろうか?
入っているなら、正常組織由来だろうか、癌由来だろうか?
扱いやすさからいくと、癌由来の樹立株かな?
そうだとすると、”標準配列”で再構築したヒトは、健常人なんだろうか?

頭にある知識だけを前提にした話です。

冬休みにお時間のある方、お付き合いください。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



17件 ( 1 〜 17 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 解決済み 削除/引用
No.3752-17 - 2011/01/05 (水) 21:45:01 - Actias
皆様、寝言へのお付き合いをいただきましてありがとうございました。

寝言とはいえ、最初の「標準配列」の定義が甘いところから議論を始めてしまい、混乱を招いてしまいました。

homo resequence
配列の上では、そういう”新人類”(死語)ができるでしょう。

(以下にはレスはつけないでください)
虫歯は生活習慣もあるかもしれませんが、口内最近のフロラに影響されるらしい(根拠未詳の耳学問)。赤ちゃんのうちに口内細菌を一掃して、虫歯の無い人の口内細菌達を植えつければ、虫歯の根本予防になるのでしょうか?
(これにて終了にします)

(無題) 削除/引用
No.3752-16 - 2011/01/05 (水) 14:31:50 - Boston-Pullman
アメリカでの子供の肥満は社会問題となっていますが、食習慣によるエピジェネティックな変化によるものだという記事を見た事があります。

その変化は元に戻らないそうです。

(無題) 削除/引用
No.3752-15 - 2011/01/05 (水) 14:20:36 - あ
主旨から少しずれるのですが、一卵性の子持ちです。
外見はそっくりで髪質とか爪の形とか、肉体的な特徴はやっぱり遺伝子だなぁと思うのですが、性格、成績(!)、あと生活習慣に依存するような例えば虫歯の数(笑)とか全然違います。。。

健常って難しいのですが、生活習慣とか出会った人とか環境の要素って、実は遺伝子より大きいのかなぁと思ってます。その選択も遺伝子に依存していたら、遺伝子が先かもしれません。よくわからなくなってきましたが。。。

(無題) 削除/引用
No.3752-14 - 2011/01/05 (水) 10:08:20 - ~
>”標準配列”で再構築したヒトは、健常人なんだろうか?
標準配列にはメチル化情報がありませんよね。
発生するかどうかも分かりませんが、
発生できてもインプリンティング疾患にはなりそうな気がします。

(無題) 削除/引用
No.3752-13 - 2011/01/04 (火) 11:26:22 - すぶりをするそぶり
話の流れからはずれてしまいますが
森岡浩之の短編集「夢の樹が接げたなら」に収録されている
「スパイス」がおすすめ。
DNA合成で好みの形質でゲノムを構築された合成人間について書かれたSF小説です。
スプラッタホラーですけど…

(無題) 削除/引用
No.3752-12 - 2011/01/03 (月) 14:09:43 - ええと
全塩基配列決定にはセレラのクレイグ ベンター(最初からそうなのか、あとで別にやったのかよくわかりません)、ジェームス ワトソン個人の組織が使われて「も」やられていますから、もとは任意のヒトであり、標準というのは存在しないというのが答えではないでしょうか?

実際に世界規模の共同研究では、複数のひとからの遺伝子の提供をうけて個人がわからないようにしてつかったとありますが、、、

よって、クレイグ ベンターの遺伝子を再構築すれば彼のクローンができます。ワトソンと違ったところを半々にすれば、「ジェームス ベンター」のキメラです。

(無題) 削除/引用
No.3752-11 - 2011/01/03 (月) 05:37:48 - おお
そういえば、人種によってはネアンデルタール人の遺伝子配列が1-4%見つかっていますね。

(無題) 削除/引用
No.3752-10 - 2011/01/01 (土) 19:20:25 - おお
homo resequence
っていう新しい人類

(無題) 削除/引用
No.3752-9 - 2010/12/31 (金) 15:34:12 - おお
けんじょう人といえどゲイの人もいるだろうし。

(無題) 削除/引用
No.3752-8 - 2010/12/31 (金) 05:16:54 - Boston-Pullman
Y染色体がないと話にならないので、男性由来細胞というのは間違いないですよね。

(無題) 削除/引用
No.3752-7 - 2010/12/30 (木) 23:47:02 - おお
そう言えばNIHとかででゲノム情報をさがすと、コンティングにつかわれた BACやCOSの情報にいき当たりますね。それを基準にして配列を表示しているとかんがえると、、、

(無題) 削除/引用
No.3752-6 - 2010/12/30 (木) 19:32:14 - Actias
寝言なので、あまり深く関わっていただくと申し訳ないですが...

「標準配列」は、resequence で使う、基準にする配列です。
マウスだと、RPCI-23 BAC RPCI-24 BAC の C57BL/6J という系統の配列を使いますが、ヒトの場合は、系統っていうのが無いので、でもどれかを基準にしないとものは言えないし、と、考え、基準にしている配列って、どういう性状のモノかな?と思った次第です。

>いまの配列情報はがん細胞だけでなく、健常人からの血液やプライマリーカルチャーとか色々な配列情報から成り立っています

がん細胞が結構な割合で入っていれば、その情報で「再構築」したヒトの姿はがんだらけとは言わずとも、結構ハイリスクなヒトだろうし、まぜこぜで癌リスクのある遺伝子変異が消去されているなら、これまた「再構築」したヒトの姿はどんな感じだろうかと。

自分が使っているプロモーターレポーターとかcDNA 発現ベクターが、塩基配列データベースとまったく一緒ではないときがありますが、
「これって何を調べてるんだっけ?」
という自問自答も、この寝言の深層心理かもしれません。

(無題) 削除/引用
No.3752-5 - 2010/12/30 (木) 16:05:29 - ンンノ
個体の議論に関しては、そもそも健常人っていう言葉の定義が?

普通って何?っていうレベルの話ではありませんか。

(無題) 削除/引用
No.3752-4 - 2010/12/30 (木) 14:04:38 - とおりすがい
一応表向きは混ぜこぜだけれども結構な割合でクレイグ・ベンターという話が出ていませんでしたっけ、昔。

(無題) 削除/引用
No.3752-3 - 2010/12/30 (木) 13:56:30 - Boston-Pullman
もし私がゲノムプロジェクトを統括する立場であったら、自分の配列を読んでほしいと冗談半分で言います。

固定したサンプルからでも技術的にゲノムを抽出して、解析出来るのであれば、アインシュタインの配列がどんなものなのか興味ありますね。でも、標準配列にはならないでしょうね。

標準という表現として、保守的な考え方ですが白人男性のゲノムになるんだと思います。sperm からなら簡単にゲノムを抽出出来ますし。意外と歴代アメリカ大統領のゲノムだったり。その逆に囚人とか。

標準と言いつつも、一般的な人ではない気がします。

(無題) 削除/引用
No.3752-2 - 2010/12/30 (木) 11:56:50 - おお
シーケンスで使う”標準配列”

いまの配列情報はがん細胞だけでなく、健常人からの血液やプライマリーカルチャーとか色々な配列情報から成り立っています。あなたのいう標準配列って何をイメージしていますか?

冬休みの寝言 ゲノム情報から再構築したヒトは健常人? 削除/引用
No.3752-1 - 2010/12/30 (木) 11:21:19 - Actias
ヒトゲノム、というのをぼんやり考えていました。

昔のクローン解析の寄せ集め時代から、高速シーケンサーの時代に移り、たくさんの配列情報が出てくるようになりました。
それでふと、リシーケンスで使う”標準配列”がどういうモノ由来だろうか、と考えました。

当然、DNAを抽出しやすいサンプル由来だろうな、と思います。
それなら培養細胞は入っているんだろうか?
入っているなら、正常組織由来だろうか、癌由来だろうか?
扱いやすさからいくと、癌由来の樹立株かな?
そうだとすると、”標準配列”で再構築したヒトは、健常人なんだろうか?

頭にある知識だけを前提にした話です。

冬休みにお時間のある方、お付き合いください。

17件 ( 1 〜 17 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を