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sepharoseを吸わずに・・・ トピック削除
No.356-TOPIC - 2009/04/19 (日) 17:20:01 - 羞恥心
いつも参考にさせてもらっています。

くだらない質問で恐縮なのですが、sepharose beads を 1xSDS-PAGE buffer で直接加熱処理し、上清のほぼ全量をSDSゲルにアプライしたいのですが、どうしてもチップに sepharose が詰まってしまい、無理に吸おうとすると泡だってしまいます。
みなさんは(全量をアプライしたい場合)どういう工夫をされてますでしょうか?

よろしくお願いします。
 
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No.356-11 - 2009/04/20 (月) 12:44:54 - 羞恥心
>通りがかりさん

なるほど、口径がそんなに違うのですね!
重要な情報をありがとうございました。
早速トライしてみます。

言葉足らずでした。
底に届かないかもと書いたのは、ウチの 1.5ml tube は底が round なので、吸い込み口が厳密には底に届かないんです(翼?の部分が引っかかってしまう)。

(無題) 削除/引用
No.356-10 - 2009/04/20 (月) 12:02:25 - 通りがかり
> フラットだと 1.5ml tube の底まで先端が行かないと思うのですが、

どういう意味でしょう?長さは 7~8cmあるので普通にチューブの底に届きますが。先は柔らかいですけど、ビーズが溜まった中に突き刺して底に届くくらいの堅さはありますよ。

> ビーズを吸い込まなくて良いとかあるのでしょうか?

ラウンド型のローディングチップは口径が 0.5mm 程度なのに対し、フラット型では私が使っている物は 0.17mm です。詰まりが皆無ではないですが、かなり改善できるはずです。

(無題) 削除/引用
No.356-9 - 2009/04/20 (月) 10:31:26 - 羞恥心
>おおさん

なるほど、アガロースゲルからDNAを精製するような要領でやれば、確かにできますね!(何で今まで気づかなかったんだろう・・・)

>通りすがりさん

フラットではないタイプを使っております。
フラットだと 1.5ml tube の底まで先端が行かないと思うのですが、ビーズを吸い込まなくて良いとかあるのでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.356-8 - 2009/04/20 (月) 09:26:44 - 通りがかり
フラットタイプのローディングチップはお使いですか?

(無題) 削除/引用
No.356-7 - 2009/04/20 (月) 08:15:03 - おお
>[Re:6] 羞恥心さんは書きました :
> >おおさん
>
> すみません、書き忘れていました。
> 空のスピンカラムはどこでも1つ200円以上はするので、使いたくないんです。
>
じゃあホームメードでつくりますか。
エッペンの底にちいさめのニードルで
穴を開けてそこにグラスウールとかグラスビーズとか
たぶん小さく切った濾紙を数枚しく
とかして、そのエッペンのしたに
加工していないエッペンをかさね
2段にします。念のためパラフィルムで
2段のエッペンを固定して、上のエッペンに
サンプルを乗せて遠心。サンプルを乗せる前に
いちどバッファーを乗せて、遠心し、濾紙などを
湿らせておいた方がいいかもしれません。

遠心機、強さによっては上のエッペンが外側にはじき飛ばされることが
ありますので、一応予備的にためして妥当な条件を
見つけてくささい。

(無題) 削除/引用
No.356-6 - 2009/04/20 (月) 06:13:13 - 羞恥心
>おおさん

すみません、書き忘れていました。
空のスピンカラムはどこでも1つ200円以上はするので、使いたくないんです。

チップの先を押し付けて吸って他のエッペンに移し、遠心という方法は良いなと思いました。
1%SDS入りの液で泡だった場合、遠心で泡が消えるのか早速試してみます。
ありがとうございました。

>Aさん

コメントありがとうございました。
SDSゲルでの泳動をしたいので、できればローディングチップで吸い取りたいと思っています。
先を切ったチップでSDSにアプライする場合、サンプルが上手くアプライできないことはないでしょうか?

(無題) 削除/引用
No.356-5 - 2009/04/20 (月) 03:20:30 - A
ビーズ上に残っているかもしれない蛋白質はアプライしたくない
ということですか?もしそうでないのであればサンプルバッファーの
量を調整してビーズごとウェルのせてしまえばいいかと思います。
ビーズ自身はゲルに入っていくことはありませんからウェル上に
ビーズだけが残るはずで、以前そうしましたがバンドが乱れるなどの
問題が発生したことはありません。チップの先を少し切ればビーズ
ごと吸い取れるはずです。

(無題) 削除/引用
No.356-4 - 2009/04/19 (日) 17:37:22 - おお
一度泡だっても良いから無理に吸って、違うチューブに移して、
スピンダウンしてから、もう一度吸ってあプライする。

(無題) 削除/引用
No.356-3 - 2009/04/19 (日) 17:33:23 - おお
チップの先を底に押し付けた状態で吸う(ローディングチップでは厳しいか、、、)
ん、ローディングチップだと大丈夫そうだけど。

(無題) 削除/引用
No.356-2 - 2009/04/19 (日) 17:29:16 - おお
0.2/0.4umのフィルターカップ(エッペンチューブ型)で、フィルターをかける。

sepharoseを吸わずに・・・ 削除/引用
No.356-1 - 2009/04/19 (日) 17:20:01 - 羞恥心
いつも参考にさせてもらっています。

くだらない質問で恐縮なのですが、sepharose beads を 1xSDS-PAGE buffer で直接加熱処理し、上清のほぼ全量をSDSゲルにアプライしたいのですが、どうしてもチップに sepharose が詰まってしまい、無理に吸おうとすると泡だってしまいます。
みなさんは(全量をアプライしたい場合)どういう工夫をされてますでしょうか?

よろしくお願いします。

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