Bio Technical フォーラム

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POP6&47cmキャピラリ トピック削除
No.3550-TOPIC - 2010/11/20 (土) 06:39:19 - 310
いつも助けていただきありがとうございます。おかげさまでシーケンス反応は、うまく進んでいます。

シーケンスのデータも大体は大丈夫なのですが、POP4&47cmキャピラリを使っている所為か、時折2-4BASEほどの長さの単一塩基の繰り返し（gggやttttなど）の数を間違えます。もう少し分離能を上げたいと思っていますが、GENESCANの合間合間にDNAシークエンスをしているため、できれば47cmキャピラリで行ないたいと思っています。

POP6&47cmキャピラリの組み合わせをされている方、POP4に比べ読み取りは向上したでしょうか？キャピラリを交換して使い分けている方、保存の際に気をつけるべきことやキャピラリを劣化させないコツがありましたらお教えください。ABIにも聞いていますが、ユーザー側からの意見を聞きたいと思い投稿した次第です。

いつも聞いてばかりで申し訳ありませんがよろしくお願いします。
　
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.3550-2 - 2010/11/25 (木) 13:25:20 - 310
ABIからの回答で、47cmキャピラリでPOP6にすると配列の読みはじめが良くなる。しかしそれ以外の配列の解析はPOP4の方が優れていると言われました。読み始めを慎重に確認することにしてPOP4を使い続けることにします。

POP6&47cmキャピラリ 削除/引用
No.3550-1 - 2010/11/20 (土) 06:39:19 - 310
いつも助けていただきありがとうございます。おかげさまでシーケンス反応は、うまく進んでいます。

シーケンスのデータも大体は大丈夫なのですが、POP4&47cmキャピラリを使っている所為か、時折2-4BASEほどの長さの単一塩基の繰り返し（gggやttttなど）の数を間違えます。もう少し分離能を上げたいと思っていますが、GENESCANの合間合間にDNAシークエンスをしているため、できれば47cmキャピラリで行ないたいと思っています。

POP6&47cmキャピラリの組み合わせをされている方、POP4に比べ読み取りは向上したでしょうか？キャピラリを交換して使い分けている方、保存の際に気をつけるべきことやキャピラリを劣化させないコツがありましたらお教えください。ABIにも聞いていますが、ユーザー側からの意見を聞きたいと思い投稿した次第です。

いつも聞いてばかりで申し訳ありませんがよろしくお願いします。
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