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NCBIの塩基配列の検索方法にて
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No.3530-TOPIC - 2010/11/16 (火) 17:34:25 - Pub
最近、NCBIのHPが更新されたのでしょうか、以前に比べ、塩基配列の検索方法が難しく感じ、検索方法が分らなくなりました。
今まではNCBIのNucleotideから、ある遺伝子の塩基配列を調べてましたが、現在のNCBIは遺伝子名を入れて、そこからどうやって塩基配列を得るのかわかりません。
すみませんが、検索のやり方を教えて下さい。
初歩的な質問でごめんなさい。
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No.3530-5 - 2010/11/17 (水) 10:06:11 - Pub
Actias様、ありがとうございます。
久しぶりに配列を検索したのですが、以前のフォーマットに
慣れていましたので、変貌ぶりにビックリしました。
でも、全コンテンツが見れますね。
こういう検索サイトって、あまり更新してほしくないですね。
頭の固い私にとっては特に…
(無題)
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No.3530-4 - 2010/11/16 (火) 22:10:31 -
Actias
NCBI のGene が、仕様の変更が有ったようで、以前はその遺伝子の全コンテンツが一気に表示されてましたが、今は、まず最初の十数行、それから下部のデータ、というようになっています。
そのため、はじめてみたときは、
「見出しだけで、役立たず」
と思いましたが、しばらく待つと、全コンテンツが表示されます。
通信が遅いとか、パソコンが遅いとかのときに、
「見出ししか出ない」
と、勘違いします。
(無題)
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No.3530-3 - 2010/11/16 (火) 18:53:20 - Pub
確かに配列へのリンクがございました。
目的の遺伝子の配列も分りました。
簡単な質問で申し訳ありませんでしたが、解決することができました。
助かりました。
(無題)
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No.3530-2 - 2010/11/16 (火) 18:21:47 - nnn
NCBIでの遺伝子名からその配列の検索でしたら
Gene (gene-centered information)のページが有用かと思います。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/
検索後、目的の種の、目的遺伝子のページに飛んだら、
ページ中ほどの、NCBI Reference Sequences (RefSeq)という項目に
遺伝子配列へのリンクがあると思います。
NCBIの塩基配列の検索方法にて
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No.3530-1 - 2010/11/16 (火) 17:34:25 - Pub
最近、NCBIのHPが更新されたのでしょうか、以前に比べ、塩基配列の検索方法が難しく感じ、検索方法が分らなくなりました。
今まではNCBIのNucleotideから、ある遺伝子の塩基配列を調べてましたが、現在のNCBIは遺伝子名を入れて、そこからどうやって塩基配列を得るのかわかりません。
すみませんが、検索のやり方を教えて下さい。
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