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スレ主です 削除/引用 No.3509-10 - 2010/11/12 (金) 12:19:40 - 素人です 皆様本当にありがとうございます。 PC音痴の私でも おかげさまで解決できました。 深く感謝申し上げます。

(無題) 削除/引用 No.3509-9 - 2010/11/12 (金) 11:15:55 - ンンノ ワープロやテキストエディタで「gi」を「, 」や「 」に置換すれば済むことじゃないかと。

(無題) 削除/引用 No.3509-8 - 2010/11/12 (金) 11:04:53 - Ｔ Excel で right 関数でも使えば一発ですけど．．．

スレ主です 削除/引用 No.3509-7 - 2010/11/12 (金) 10:55:25 - 素人です （無題）さん、 どうもありがとうございました。 おかげさまでDAVIDにて解析できました！！ しかし、１つだけまだ問題が残っていて もしご存じでしたら アドバイスをいただきたいです。 それは、 蛋白が1000位あるときに、 １つずつ”gi”を削っていくのが途方もなく 大変だということです。 exelの表で gi111111 gi222222 . . . と一列に並ぶNumberを一度に解析したいとき 手作業ではなく うまくgiを取り除いた番号部分のみの抽出を やる方法がありましたら ぜひご教示いただきたく存じます。 たびたびすいません。

(無題) 削除/引用 No.3509-6 - 2010/11/12 (金) 09:30:35 - Ｔ NCBI と同じく、gi を除いた 119578453 をペーストし、Gene List をチェックして submit します。Select Identifier は何でもかまいません。 すると Gene Conversion Tool を使えという画面が出るので、そのまま Submit to Conversion Tool のボタンを押します。 そうすると次の画面でサマリが出て、 119578453 が Protein GI Number にマップされているのが分かります。あとは Convert All のリンクを押せば変換の結果が表示され、そこから DAVID に直接データを渡す事ができます。

スレ主です 削除/引用 No.3509-5 - 2010/11/12 (金) 08:24:11 - 素人です レスありがとうございます。こちらは 相変わらずDAVIDに受け入れてもらえません。 具体的にやっていることは DAVIDのpageでFunctional Annotationのところにいき Paste a list にgi119578453を入れ、 select identifierで全てを試し、 list type をgene listにして submit　してみたのですが 駄目なのです。 （無題）さん、すいませんが もう少し詳しくやり方をご教示お願いできませんでしょうか？ どうぞ何卒よろしくお願い申し上げます。

(無題) 削除/引用 No.3509-4 - 2010/11/11 (木) 18:19:24 - Ｔ gi119578453 を入れてみましたが、ちゃんと変換できましたよ。

スレ主です 削除/引用 No.3509-3 - 2010/11/11 (木) 16:58:27 - 素人です 言い忘れました。DAVIDのconversionを全て試してみましたが駄目だったのです。どなたかご教示お願い申し上げます。

(無題) 削除/引用 No.3509-2 - 2010/11/11 (木) 16:25:54 - Ｔ ちゃんと DAVID のサイトに Gene ID Conversion ツールが用意されてますけど。

DAVID用GI numberへの変換方法 削除/引用 No.3509-1 - 2010/11/11 (木) 15:31:56 - 素人です 素人ですいませんが、質問させてください。LC-MS/MSで蛋白の同定をしました。sequestのdata　baseを使って解析したところ、gi119578453のようなaccession Number が得られました。このaccession　numberのうち、giを除いた数字の部分をNCBIのproteinサイトに入力すると蛋白の説明画面にいくことができました。そこで網羅的にgene　ontology　を調べるために、DAVIDのサイトでこれらのaccession　numberを張り付けてみたところ、accession　numberを受け入れてくれず、numberの変換を求められています。UniprotというサイトでGI　numberの変換がうまくいくと聞いてやってみたのですが、だめでした。どなたかぜひともsequestのdata　baseのGI　accession　numberから、DAVIDが受け入れてくれるGI　numberへの変換をご存じの方がおられましたらご教示願います。

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