BioTechnicalフォーラム [受容体の同定方法]

受容体の同定方法

No.3402-TOPIC - 2010/10/24 (日) 14:03:02 - ラミちゃん

未分化と分化の細胞に分けて、未分化の細胞で多く発現する
受容体を探索したいと考えてます。
その探索方法なのですが、今のところ、マイクロアレイによる
網羅的解析しか思いつきません…。
動物種の問題もあって、アレイを受託サービスに出す場合、
費用が高いため、なかなか手を出し辛い問題があります。
そこで、このような探索方法で、比較的安価な方法はないでしょうか？
　

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No.3402-8 - 2010/10/25 (月) 14:48:06 - Boston-Pullman

細胞膜外ドメインをビオチン標識して、濃縮後、LC/MS。

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No.3402-7 - 2010/10/25 (月) 13:17:45 - ラミちゃん

おお様、アドバイスありがとうございます。
膜タンパクの受容体の探索方法の件、ありがとうございました。
方法を検討したいと思います。

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No.3402-6 - 2010/10/24 (日) 15:57:50 - おお

もし膜タンパクの受容体を考えているなら、
膜ふらくしょんをとってきて、
２D-dige
膜タンパクであれば受容体でなくてもひっかかりますが、
とーたーるのライセーとよりいいかも。

あとはたんにディープシーケンシングとか、
サブストラクションライブラリーをつくっておいて、
くろーんをひとつずつシーケンス。
当然受容体いがいもひっかかりますけど。

(無題)

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No.3402-5 - 2010/10/24 (日) 15:29:25 - ラミちゃん

あ様、ありがとうございます。
PCRアレイって方法があるのですね。
自分が調べたい遺伝子をある程度網羅的に調べられそう
ですね。
ただ、調べる遺伝子もどうしても限定されるって面で、
少し不安があるかと思いました。

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No.3402-4 - 2010/10/24 (日) 15:04:20 - あ

RT-PCRの96well アレイというのがあります。

http://www.sabiosciences.com/pcrarrayprotocolguide.php

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No.3402-3 - 2010/10/24 (日) 14:53:55 - ラミちゃん

おお様、ご回答ありがとうございます。
受容体総当たりのPCRですか！
どれだけの数の受容体があるかは知りませんが、大変な作業ですね(^^;
アレイ以外の探索方法っていったら、もうそのようなやり方しか
無いのかもしれませんね。