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マウスで発現なしという遺伝子 トピック削除
No.3296-TOPIC - 2010/10/04 (月) 16:45:50 - gene
ヒトを含む哺乳類一般では発現しているが、マウスでは発現していないという遺伝子を調べたいと思います。どのようなやり方がありますでしょうか。
 
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(無題) 削除/引用
No.3296-13 - 2010/10/07 (木) 14:32:01 - cDNA
とぴ主さんは、発現していない遺伝子、と書いていますが、遺伝子自体が存在しない、も目的には含まれている気がします。

書き方の問題に一票。

おおさんに一票。 削除/引用
No.3296-12 - 2010/10/07 (木) 06:25:53 - 名無し
面白いかも。あるいは面白くなるかも。

人間では発症する病気なんだけど、マウスでは遺伝子改変をしない限り絶対に発症しない病気ってありますよね。

なので、このマウスで発現無しの遺伝子スクリーニングって、そういう病気の研究に役立ったりしないかな?

(無題) 削除/引用
No.3296-11 - 2010/10/06 (水) 16:38:41 - か
五分後に書き込み
よほどの暇人か…

まあそれはさておき
ミオシンは当時話題になりました
実は強いエビデンスはない論文ですがネイチャーにのってます
実は霊長類でも猿まではあって
その後チンパンジーから欠損したそうです
ああいう発見はすごいと思いました
発現部位が顎であることと脳容積を結びつけられるあたりに頭のよさを感じます

いずれにせよ
下手な鉄砲はあたるものではないので入念なスクリーニングが必要です

最近TLRで面白い発見がありました
ヒトとマウスでは認識物質に違いがあるんだと
遺伝子の有無にだけ着目するとこんなことわかりませんね

(無題) 削除/引用
No.3296-10 - 2010/10/06 (水) 04:46:10 - 通りすがり
 なんらかのデータベースを使ってSystematicに調べる方法を考えてらっしゃるんだと思いますが、なんか難しそうですね。

 「○○で発現している遺伝子リスト」はあると思いますけど、そのリストにないからといって、発現しないことが確認されているわけではないでしょうし。(発現していることが確認されていない、だけで)

 また、どの程度だと「発現していない」と言えるかもなかなか判定が難しいかもしれません。Real time RT-PCRなどは感度が非常に高くて、その細胞に発現していないはずの他細胞種のマーカーなども検出してしまいますし。「発現していない」の線引きも難しそうです。

(無題) 削除/引用
No.3296-9 - 2010/10/06 (水) 03:21:59 - おお
>げっし類にあって霊長類で退化した遺伝子で有名なのがミオシンです
>顎のミオシンがなくなったことで顔の形態に変化が起こり
>脳容積に変化が出たんだと

あれ、これを面白いとお考えなんですよねぇ、、、

(無題) 削除/引用
No.3296-8 - 2010/10/06 (水) 03:17:51 - おお
>いずれにせよげっし類でも発現量が少ないだけで遺伝子として存在してるわけですよね?

発現してないとかかれています。


>そうなら哺乳類と機能は似ているはずです

発現遺伝子の機能を追うのだけがバイオロジーではありません。


ある意味面白いとかきましたが、
正確にいうと面白いかもしれないという感じです。
どう研究が発展するかによるかもしれません。

うーん 削除/引用
No.3296-7 - 2010/10/06 (水) 03:12:03 - か
これ調べてなんか意味あるんですか?
面白いなんていうコメントがありますが
僕に言わせるとテーマの立て方が下手だなと

げっし類に存在しないけれども霊長類には存在するならまだわかりますが…

いずれにせよげっし類でも発現量が少ないだけで遺伝子として存在してるわけですよね?
そうなら哺乳類と機能は似ているはずです

げっし類にあって霊長類で退化した遺伝子で有名なのがミオシンです
顎のミオシンがなくなったことで顔の形態に変化が起こり
脳容積に変化が出たんだと

(無題) 削除/引用
No.3296-6 - 2010/10/05 (火) 21:53:45 - Actias
山中先生のグループがES cell-associated transcripts を見つけてきた経緯を読んで、手法の参考にしてください。

(無題) 削除/引用
No.3296-5 - 2010/10/05 (火) 15:45:09 - cDNA
ちなみに、マウスだけで発現「していない」遺伝子を探す、というのはどんなことを調べたいからなのでしょうか? 差し障りがなければ教えてください。

(無題) 削除/引用
No.3296-4 - 2010/10/05 (火) 13:28:43 - おお
これはある意味面白いと思うんですけどねぇ、、、まあデーターベース作っている段階できがついて、押さえられているものもあるかもしれませんけどね。一つはしってますがあまり面白くないやつです。ほかにきいたことがあるのがあるかもしれません。
細かいことはいいません。よく考えてください。私の書いたコメントにもひとつの方向性としてヒントがあります。

(無題) 削除/引用
No.3296-3 - 2010/10/05 (火) 08:27:03 - Actias
「存在」でなく「発現」ですね?

(無題) 削除/引用
No.3296-2 - 2010/10/04 (月) 17:13:19 - しっぽ
そういう方法を考えるのが“研究者”の仕事なのでは?

マウスで発現なしという遺伝子 削除/引用
No.3296-1 - 2010/10/04 (月) 16:45:50 - gene
ヒトを含む哺乳類一般では発現しているが、マウスでは発現していないという遺伝子を調べたいと思います。どのようなやり方がありますでしょうか。

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