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ウェスタンの抗体の特異性について トピック削除
No.3244-TOPIC - 2010/09/21 (火) 22:20:27 - アンチな体
リン酸化を受ける部位を特定するために、
phospho-(Ser/Thr)Phe抗体を購入しました。
これはSer/Thrの-1の位置にタイロシン(Y)、トリプトファン(W)、フェニルアラニン(F)のいずれかがある場合、もしくは+1の位置にフェニルアラニンがある部位に結合するという抗体なのですが、結果はそのようにはならず、
どうやらバリン(V)-セリン-アルギニン(R)という配列のセリンを認識しているような結果になりそうなのです。

このようなYSやSFなどの認識する抗体が、VSあるいはSRを認識するようなことはあるのでしょうか?
ご教授くださいますようよろしくお願い致します。
 
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(無題) 削除/引用
No.3244-6 - 2010/09/22 (水) 21:20:59 - ATGC
経験的(といってもたいした数ではないんですけど)な印象だけどエピトープが小さいというか構造的に単純なものや非常に狭い範囲を認識するやつだと、結構結果が動きやすいというか安定しない気が去年くらいからしてる。リン酸化部位を認識する抗体をつくるため、リン酸化部位含んでるペプチドで免疫してその部位に対するモノクロをいくつか取って比べると何か違うという話は昔きいたことある。

(無題) 削除/引用
No.3244-5 - 2010/09/22 (水) 10:31:14 - 中年
モノクロですか?ポリクロですか?

扱っておられるような抗リン酸化ペプチド抗体は、(Y/W/F)p(S/T)を認識し(Y/W/F)(S/T)を認識しないということは保証されていますが、他の配列を認識しないということはテストもされていないでしょうね。そもそも、(Y/W/F)p(S/T)またはp(S/T)Fのいずれかを認識するということですが、その両者の共通性って何なのかと考えると、予期しない配列を認識する可能性も大いにあると思います。

(無題) 削除/引用
No.3244-4 - 2010/09/22 (水) 00:42:44 - おお
>どうやらバリン(V)-セリン-アルギニン(R)という配列のセリンを認識しているような結果になりそうなのです。

従来の抗原と特異性の比較はしたの、、、
従来の抗原との特異性より低いけど認識するということはあり得そうですけど。

鬼門ですか・・・ 削除/引用
No.3244-3 - 2010/09/21 (火) 22:52:09 - アンチな体
ただ、脱リン酸化酵素を用いた比較ではある程度のリン酸化状態、非リン酸化状態を認識できますので、リン酸化されていない部位を認識ということはあまり考えにくいのです。

ってか 削除/引用
No.3244-2 - 2010/09/21 (火) 22:44:24 - ami
> どうやらバリン(V)-セリン-アルギニン(R)という配列のセリンを認識しているような結果になりそうなのです。

経験的には、いろんな変な配列認識したり、リン酸化してない配列認識したりしますよね・・・リン酸化セリンスレオニン抗体は鬼門だと思ってます。

ウェスタンの抗体の特異性について 削除/引用
No.3244-1 - 2010/09/21 (火) 22:20:27 - アンチな体
リン酸化を受ける部位を特定するために、
phospho-(Ser/Thr)Phe抗体を購入しました。
これはSer/Thrの-1の位置にタイロシン(Y)、トリプトファン(W)、フェニルアラニン(F)のいずれかがある場合、もしくは+1の位置にフェニルアラニンがある部位に結合するという抗体なのですが、結果はそのようにはならず、
どうやらバリン(V)-セリン-アルギニン(R)という配列のセリンを認識しているような結果になりそうなのです。

このようなYSやSFなどの認識する抗体が、VSあるいはSRを認識するようなことはあるのでしょうか?
ご教授くださいますようよろしくお願い致します。

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