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検索方法について
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No.3228-TOPIC - 2010/09/18 (土) 18:50:18 - 遺伝子
いつも勉強させてもらってます。
基本的なことで申し訳ないのですがお聞きしたくて書き込みました。
プライマーの配列から、BLASTをかけてGene Acc.を調べてといて、と言われたのですが、いまいち検索の方法がよくわかりません。
どなたかご存知の方がいましたら、ご教授ください。
よろしくお願いします。
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No.3228-5 - 2010/09/20 (月) 09:24:17 - 遺伝子
もう帰るさん、stuさん、おおさん
お返事ありがとうございました。
無事にプライマーからGene Acc.わかりました。
(無題)
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No.3228-4 - 2010/09/19 (日) 03:50:48 -
おお
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi?LINK_LOC=BlastHome
プライマーブラストがべんりかも。
ペアーで配列を持ってないとかからないかなぁ
(無題)
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No.3228-3 - 2010/09/18 (土) 20:03:17 - stu
こういことは言葉だけでは伝えずらいです。
こういうのを見て勉強してください
http://togotv.dbcls.jp/20100415.html#p01
blast結果で100%マッチする配列の詳細画面のAccessionがあなたの求めるものです。
(無題)
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No.3228-2 - 2010/09/18 (土) 19:36:48 - もう帰る
そういうことは素直に分からないと言って、ボスに聞くのが早道です。
対象遺伝子、生物種、対象データベースがノーヒントの一般人では検索方法の提案は不可能です。
検索方法について
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No.3228-1 - 2010/09/18 (土) 18:50:18 - 遺伝子
いつも勉強させてもらってます。
基本的なことで申し訳ないのですがお聞きしたくて書き込みました。
プライマーの配列から、BLASTをかけてGene Acc.を調べてといて、と言われたのですが、いまいち検索の方法がよくわかりません。
どなたかご存知の方がいましたら、ご教授ください。
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