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(無題) 削除/引用 No.3206-3 - 2010/09/18 (土) 01:37:54 - mek アドバイスありがとうございます。 おお様にご提示して頂きました発現プロファイルを示したサイトの存在を私は今まで知らず、MnSODの発現プロファイル以外にも色々と活用させて頂きました。 具体的にご提示下さったHL60やRajiなどを含めて、これから色々と検討させていただきたいと思います。 また論文で細胞種によるMnSODのプロモーターの活性を調べていた際にはmRNAの発現量のデータで比較をしておりました。 確かにmRNA発現量=転写活性ではありませんが、非常に強力なツールを教えて頂きありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.3206-2 - 2010/09/15 (水) 15:45:57 - おお 例えば en.wikipedia.org/wiki/SOD2 en.wikipedia.org/wiki/File:PBB_GE_SOD2_215223_s_at_tn.png 発現プロファイルがここにでています。 HL60 Raji などの細胞は表ではベイサルなレベルです。でwhole bloodでシグナルが非常につよいです。まあ比較なのでべーサルに高いのかもしれませんけど。 マイクロアレーのデーターベースはいろいろあるのでぐぐったりして探してみて使えそうなのを何個か試していいと思いますがたとえば www.ebi.ac.uk/microarray-as/ae/ でGene Expression Atlas(右)にSOD2を入力してやって検索すると、 www.ebi.ac.uk/gxa/gene/ENSG00000112096 E-MTAB-37: Transcription profiling of human multiple cancer cell lines (950 samples) こんなのがあって www.ebi.ac.uk/gxa/experiment/E-MTAB-37/ENSG00000112096 細胞間でマイクロアレーのシグナルの比較ができます。この実験は人癌細胞株を950個横並びにして比較しており、相対的にどれが高くてどれが低いというのがすぐわかるようになってます。 mRNA発現量=転写活性と言い切れませんが、候補はピックアップできるかもしれません。 Please add "http://" in front of the addresses.

MnSODの低発現株について 削除/引用 No.3206-1 - 2010/09/15 (水) 14:52:00 - mek MnSOD発現の為のシグナル経路が壊れておらず、MnSODプロモーターの活性が低い（MnSODの発現量が低い）細胞株をマウスとヒトで探しております。 MｎSODプロモーターの活性化を調べる目的での使用を考えておりますが、MnSODの構造遺伝子が破壊されている細胞株でも、MｎSODプロモーターの活性が高いものですと条件には合いません。 逆に活性が強いような細胞株は大量に見つかるのですが･･････。 このような条件に適した細胞株（ヒト・マウス）をご存じの方がいらっしゃいましたらご教授お願い致します。

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