Bio Technical フォーラム

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(無題) 削除/引用
No.3183-2 - 2010/09/10 (金) 19:41:00 - うーん
まず、その目的の遺伝子はそのcDNAのソースに豊富にある保証はあるのですか?

私ならまず、クローニングしたい遺伝子が発現している細胞や、組織を調べ、そこからcDNAを作製します。

次に、クローニングに使用するprimerの場所を変えたりしますかね。

Total cDNAからの遺伝子クローニング 削除/引用
No.3183-1 - 2010/09/10 (金) 19:37:13 - TcKIC
培養細胞からのトータルcDNAを用いて、目的の遺伝子をPCRクローニングしています。
(方法はIsogenでRNA抽出、DNAse処理、逆転写PCR後(superscriptIII, ReverTraAなど)、目的遺伝子のプライマーでPCRする)

PCRで増幅が得られない場合は、しょうがなくESTクローンなどを購入しております。ですがラボの財政的に(またクローンを待つ時間短縮のため)できるかぎりトータルcDNAからクローニングできればと考えております。

これまでの成果は1kbp以下の遺伝子はよく得られるのですが、1kbp以上の遺伝子をなかなかトータルcDNAから得ることが出来ません。

できるかぎり長いcDNAを得られるためには、どのような工夫が必要でしょうか?
よろしくお願いします。

今まで逆転写に用いるRNA量や、逆転写時のプライマー(ランダム、ポリA)、逆転写の伸長時間などを変えてみましたが、おおきな変化がありませんでした。

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