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(無題) 削除/引用 No.3153-9 - 2010/09/07 (火) 19:13:08 - Kanata 横ですが おおさん、 1次元目でも非変性の条件で流されるのであれば、protein standard Marker(着色ずみ）を同条件で流してみるというのもありですよね。そんなにクリアにでないかもしれませんが。ＧＥにあったような2次元のＭａｐは、今ExpasyのなかのＤＢのひとつになってます。 前後しましたが、お久しぶりです。お待ちしてました。

(無題) 削除/引用 No.3153-8 - 2010/09/07 (火) 16:26:30 - おお あ、ごめんなさい。 ネーティブのページならGEとか当てにならないかも、、、よくやられるのは尿素で変性させた条件で等電点ですから、、、 ネーティブならもっとかわるかもしれませんよねpIって。。。蛋白の内部にあるアミノ酸とかかなり特殊な環境でpkもずれてますから。水にアクセスできなかったり相互作用で電離の具合が違ったり、、、 ということで、ちゃんとした答えをかけないほどぼけてしまっています。

(無題) 削除/引用 No.3153-7 - 2010/09/07 (火) 15:13:05 - native+PAGE初心者 おおさん お久しぶりです（泣） もう来られないかと思っていました。大変心強いです。 このフォーラムのみなさんはおおさんからのアドバイスを嬉しく思っています。 これからもどうぞ宜しくお願いします。 翻訳後修飾などでも変わりますしね。 GEさんでそのようなものがあるんですね。 ないかもしれませんが、一度調べてみます。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.3153-6 - 2010/09/07 (火) 02:16:46 - おお 計算上ということで、結構外れることはあるようですので、その辺は頭の片隅にでもおいておいていいかもしれません。メジャーな生物であれば実際の2Dでどこに現れるかとかデーターがあるかもしれません。 昔はゲルのイメージがでてきて、スポットをクリックするとそのタンパク質の名前が表示されるとかあったんですが、現在残っているか定かではありません。 ファルマシア(GE)が力を入れていたので彼らにきくとマップとかもっているかもしれません。ただタグを入れた時点で変わると思いますけど。

(無題) 削除/引用 No.3153-5 - 2010/09/06 (月) 18:14:13 - native+PAGE初心者 ［isoelectric point calculation］と打ち込んで自分でも探したら簡単に見つかりました。 ありがとうございました。 http://isoelectric.ovh.org/

これは如何ですか？ 削除/引用 No.3153-4 - 2010/09/06 (月) 17:30:40 - A http://au.expasy.org/tools/protparam.html

(無題) 削除/引用 No.3153-3 - 2010/09/06 (月) 17:30:02 - AP アミノ酸配列を入力すれば、各種遺伝子解析ソフト（Genetyx、DNASISなど）、あるいはWeb上のサービス（たとえば　ttp://us.expasy.org/tools/pi_tool.html）で　算出してくれます。

タンパク質の等電点を知りたい 削除/引用 No.3153-1 - 2010/09/06 (月) 16:07:49 - native PAGE初心者 みなさま教えてください。 今後、native PAGEを行うことを考えております。 そのため興味あるタンパク質の等電点がどれほどかを知る必要が出て参りました。 タンパク質の等電点を知る場合、そのアミノ酸配列から予測することは可能でしょうか？ またV5-Hisx6がそのC末に来る場合にも等電点に影響があると思います。 そういった場合の等電点の求め方をどうか教えていただけないでしょうか？ どうぞよろしくご教示ください。

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