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SSCPについて教えてください トピック削除
No.3142-TOPIC - 2010/09/03 (金) 21:42:36 - ぽっぽ
SSCPで電気泳動するDNAの量はどれくらいが最適でしょうか?
 
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No.3142-3 - 2010/09/07 (火) 16:49:48 - おお
あ、くわえて構造変化をみるということですから、なるべく最初に量をきめて、それにあわして実験する方がいいような気がしてます。

(無題) 削除/引用
No.3142-2 - 2010/09/07 (火) 16:12:15 - おお
検出系によるのでは。。。
蛍光、RI、ばあいによってはハイブリしてAPで、、この場合もそめかたしだいで検出感度はかわります。

銀染色でそめるという手もありますし、いまは一本鎖DNA/RNAをそめる蛍光色素も出回ってます。

銀染色でエチブロの十倍の感度というから、その場合1ngあれば検出は理論的に可能ですが、余裕を見て10ngはあった方がらくかも、、これくらいなら蛍光でもなんとかなると思います。これより低いならもっと感度のいい検出方法を使わないといけないと思いますが、、、ゲノムからの解析ならpcrかましますから100ng以上アプライしているだろうなぁとかってに想像しています。そう言う系なら1ugぐらい載せてもいいかもと思います。


感度は理想上の数字でバックグランドのでかたで変わりますので1オーダーぐらい多めにみるほうが検出に余裕がもてるとおもいます。

けっこうラフな想像ですがオーダー的にはそんなもんかと、、、


ああ、あと電気えいどうはどんなしすてむですか?
それによって、キャパもちがってくるので、、、
キャピラリーなんかだと、はっきりした数字は私には
わかりかねます。蛍光をつかうだろうからngオーダーは必要でしょうけど。

SSCPについて教えてください 削除/引用
No.3142-1 - 2010/09/03 (金) 21:42:36 - ぽっぽ
SSCPで電気泳動するDNAの量はどれくらいが最適でしょうか?

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