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miRNAの標準化
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No.3141-TOPIC - 2010/09/03 (金) 16:07:03 - miRNA
はじめまして。
このフォーラムでもたびたび議論になっているリアルタイムPCRの標準化についての質問です。
この間、血清中miRNAの標準化のために、C.elegans synthetic miR-39をRNA抽出の前に加えて標準化している論文を見かけました。
外来性のもので標準化できるのか、RNA抽出や増幅効率で違いがでるのではないかと疑問に思いました。
初心者なので見当違いのことを言っていたら申し訳ありません。
よろしくお願いします。
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No.3141-3 - 2010/09/04 (土) 11:28:27 - miRNA
Pumpkin様
早速の返信ありがとうございます。
この方法は
Evan M.Kroh et al. Method 50(2010)298-301
に掲載されていました。
血清miRNAを測定するときの内部標準が見つからず悩んでおりましたが、この方法も検討してみようと思います。
ありがとうございます。
(無題)
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No.3141-2 - 2010/09/03 (金) 16:58:18 - Pumpkin
添加回収試験ですね。
遺伝子発現の内部標準としてそのようなことをしている例を知らなかったので興味があります。よろしければ、掲載論文を教えてもらえませんか?その方法についてどのように言及しているのか気になります。
>RNA抽出の前に加えて標準化している
ということなので、
>RNA抽出や増幅効率で違いがでる
ことも補正しようとしているのでしょう。endogenousな遺伝子だって、この疑念は払しょくできないので、標準化用の遺伝子を入れることによって補正できるのであればこれは有用だと思います。
miRNAの標準化
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No.3141-1 - 2010/09/03 (金) 16:07:03 - miRNA
はじめまして。
このフォーラムでもたびたび議論になっているリアルタイムPCRの標準化についての質問です。
この間、血清中miRNAの標準化のために、C.elegans synthetic miR-39をRNA抽出の前に加えて標準化している論文を見かけました。
外来性のもので標準化できるのか、RNA抽出や増幅効率で違いがでるのではないかと疑問に思いました。
初心者なので見当違いのことを言っていたら申し訳ありません。
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