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ありがとうございました。 削除/引用 No.3087-3 - 2010/08/25 (水) 15:56:54 - B.W. 初めて使ったもので、使い方がよくわかっていませんでした Expectの値を10にしたら、あっさりできました。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.3087-2 - 2010/08/25 (水) 15:30:01 - toyo レスがついてないみたいなので、門外漢ですがコメントします。 >そこで、NCBIのHuman Genomeデータベースからプライマーの配列でBLASTサーチを >かけてみましたが、「No significant similarity found」と出てしまいます。 単にsignificanceの閾値を下げればよいのかなと思いますが… blastでいえば'Expect'の値を上げることに相当しそうですね。 それから、 primer-blast http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/ UCSC In-Silico PCR http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?command=start あたりは既に試されましたか?

ヒトゲノム上の特定配列の位置 削除/引用 No.3087-1 - 2010/08/24 (火) 18:22:57 - B.W. ヒトゲノムのY染色体上のマイクロサテライト用のプライマーがいくつかあります。 それぞれのプライマー配列がY染色体上のどの辺りに存在しているのか、プライマー（遺伝子座）同士がどの程度離れているか、を知りたいと思っています。 そこで、NCBIのHuman Genomeデータベースからプライマーの配列でBLASTサーチをかけてみましたが、「No significant similarity found」と出てしまいます。 たかだか２０塩基程度で検索をしているからなのかもしれませんが、どのような方法をとれば良いか、ご教授いただけますでしょうか？ Y染色体の配列を一気にダウンロード（すごいサイズになりそうですが）する方法でも構いません。 よろしくお願いします。

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