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(無題) 削除/引用 No.3024-4 - 2010/08/15 (日) 19:17:32 - Pumpkin うまく作動できてよかったですね。このソフトウェアのいいところはBlastでアノテーションがつかなくてもInterProScanの結果をGOアノテーションにマージできたりするところです。 いろいろ使ってみてください。

(無題) 削除/引用 No.3024-3 - 2010/08/15 (日) 08:43:21 - haruna Pumpkin さま 親切な対応、ありがとうございます。 別のPCで、インストールしなおし、検索をかけたところ うまくいきました。 トラブルのあったPCでは、同じように動かしても全くダメでした。 どういう原因か、わかりません。 なにか別のソフトの問題かもしれません。 しかし、blast2go、すごいです。

(無題) 削除/引用 No.3024-2 - 2010/08/15 (日) 00:35:30 - Pumpkin Blast2GOについてお教えしたのは私だと思うので、できるかぎりサポートしたいですが、Blast2GOのGoogleグループに入って直接開発者に聞いたほうが早いかもしれません。トピ主さんには最適なソフトウェアだと思うのですが、FASTA fileの読み込みまではうまくいっているのですね。数個追加されるというログはどのようなログでしょうか？ 読み込んだFASTAがアミノ酸配列で、BlastXが検索方式だとエラーでcheck your Blast DBと出てくるはずです。ちゃんとしたBlastの検索結果がいくつか帰ってくる場合（検索された配列は赤またはオレンジに塗りつぶされる）にはコネクションエラーとかがありえますが、これもerror表示されます。私はWin XPで使用していますが、今のところ問題ありません。Macだといくつかの不具合が報告されています。 Googleグループに入らなくても次のようなディスカッションは見ることが出来るので、まずは同様の症状がないかを確認してください。もうすこし詳細に書いてもらえれば、アドバイスできるかもしれません。 ttp://groups.google.com/group/blast2go/browse_thread/thread/a3705c097f2ce713#

blast2go 削除/引用 No.3024-1 - 2010/08/14 (土) 14:26:22 - haruna わたしのやりたいことは、FASTA形式で複数遺伝子の配列リストがあたえられたときに、そのリストの遺伝子それぞれについて、BLASTをかけヒットした結果を出力すること、です。 以前、このページのレスでblast2goというソフトを教えていただきました。 説明書通り、File→Load FASTA file(.fasta)でファイルを読み込ませて、 BLAST→Run BLAST Stepを選択、デフォルトのまま（でも何を選択しても）、 結果が帰ってきません。 しばらくはLogが追加されるのですが、数個分検索かけると、とまります。 これについての対処方法または、別のソフト等があればおしえてください。 perlは読めませんが、ｒのスクリプトなら読めますので、ｒでもかまいません。なにか、知識のある方、おねがいします。

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