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トリプルKOマウスのCreリコンビネーション効率 トピック削除
No.2953-TOPIC - 2010/07/29 (木) 01:23:43 - GREEN
よろしくお願いします。

遺伝子AのファミリーA1, A2, A3をすべてfloxしたマウスと組織特異的Creマウスを交配させてトリプルKOマウスを作りました。3遺伝子はすべて異なる染色体上です。

A1のシングルKOでは十分(mRNAレベルで90%前後)に対象細胞でA1が飛んでいたのですが、トリプルではA1A2A3が満足にKOされてくれません。せいぜいmRNAで20-30%程度の低下です。

DNAをチェックすると凾フバンドとfloxのバンドが同程度に両方見えます。シングルKOではfloxのバンドはかなり薄かったので、トリプルにすることでCre活性が相対的に不足してしまうのかと考えたのですが、そのような可能性はあるでしょうか。

もしそうなら、現在用いているCre(+/-)のマウスをCre(+/+)にすることで改善する可能性はあるのでしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.2953-2 - 2010/07/29 (木) 01:37:33 - TK-1
>[Re:1] GREENさんは書きました :
> よろしくお願いします。
>
> 遺伝子AのファミリーA1, A2, A3をすべてfloxしたマウスと組織特異的Creマウスを交配させてトリプルKOマウスを作りました。3遺伝子はすべて異なる染色体上です。
>
> A1のシングルKOでは十分(mRNAレベルで90%前後)に対象細胞でA1が飛んでいたのですが、トリプルではA1A2A3が満足にKOされてくれません。せいぜいmRNAで20-30%程度の低下です。
>
> DNAをチェックすると凾フバンドとfloxのバンドが同程度に両方見えます。シングルKOではfloxのバンドはかなり薄かったので、トリプルにすることでCre活性が相対的に不足してしまうのかと考えたのですが、そのような可能性はあるでしょうか。
>
> もしそうなら、現在用いているCre(+/-)のマウスをCre(+/+)にすることで改善する可能性はあるのでしょうか?
A1, A2, A3が転写制御因子でCreの発現に影響を与えている可能性。
そう出なければ、単純にselectionがかかったんじゃないでしょうか。遺伝子Aが分化や増殖に必要で、一つだけつぶしたときにはredundencyで何とかなっていたものが、全部つぶしたから、切れ残りの細胞だけが生き残ったって感じでしょうか。そもそもシングルノックアウトで90%程度しか切れないのであれば用意に予測できる事態だと思います。

トリプルKOマウスのCreリコンビネーション効率 削除/引用
No.2953-1 - 2010/07/29 (木) 01:23:43 - GREEN
よろしくお願いします。

遺伝子AのファミリーA1, A2, A3をすべてfloxしたマウスと組織特異的Creマウスを交配させてトリプルKOマウスを作りました。3遺伝子はすべて異なる染色体上です。

A1のシングルKOでは十分(mRNAレベルで90%前後)に対象細胞でA1が飛んでいたのですが、トリプルではA1A2A3が満足にKOされてくれません。せいぜいmRNAで20-30%程度の低下です。

DNAをチェックすると凾フバンドとfloxのバンドが同程度に両方見えます。シングルKOではfloxのバンドはかなり薄かったので、トリプルにすることでCre活性が相対的に不足してしまうのかと考えたのですが、そのような可能性はあるでしょうか。

もしそうなら、現在用いているCre(+/-)のマウスをCre(+/+)にすることで改善する可能性はあるのでしょうか?

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