Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

完全長cDNA トピック削除
No.2897-TOPIC - 2010/07/16 (金) 12:06:25 - kitanokunikara
完全長cDNAをとりたいと思っている者です。
キットの説明書を読み比べても、インビトロジェンのGeneRacer、クローンマイナー、3'5'RACEシステムの違いが理解できません。
GeneRacerはGene-Specific Primerを使うようですが、GSPを作るための既知の配列がない場合は、GeneRacerは使えないのでしょうか?
クロンテックだったら、In-Fusion SMARTer cDNA library construction kit、SMART cDNA Library construction Kitあたりを考えているのですが・・・
皆様、どのような点でキットを比較されているのでしょうか?
また、完全長cDNA=cDNAライブラリーと考えていいのでしょうか?
初心者で的を得ていないことを書いているかもしれませんが、ご助言いただけると幸いです。
お願いします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2897-5 - 2010/07/16 (金) 23:38:32 - take_
用語は勉強してください。

遺伝子が決まってるなら、
www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/GNPcloneja.html
www.nbrc.nite.go.jp/hflcdna.html

で安く手に入るかも。

(無題) 削除/引用
No.2897-4 - 2010/07/16 (金) 14:30:04 - Pumpkin
方法がごちゃまぜになっていますが、

@cDNAライブラリーを構築して、その中から釣り上げる。
AmRNAからRACE法を用いて、部分配列を取得して、PCRで全長をあげる。

のどちらかだと思います。ただ、みなさんの言うように、完全長であることもあるでしょうしないこともあるでしょう。そういう場合はRACE法、プライマーエクステンションなどいくつかの方法を組み合わせる必要があります。こういうのって大学の「遺伝子工学」的な講義で習いませんか?習っていなければ、遺伝子工学の教科書なんかにクローニングストラテジーがあるとおもうので、勉強してください。

(無題) 削除/引用
No.2897-3 - 2010/07/16 (金) 13:05:05 - DDD
>GeneRacerはGene-Specific Primerを使うようですが、GSPを作るための既知の配列がない場合は、GeneRacerは使えないのでしょうか?


まずこのKitにおいて、どういう目的でGSPを使用しているか理解しましたか?


>また、完全長cDNA=cDNAライブラリーと考えていいのでしょうか?

読んで字のごとく…
完全長cDNAはライブラリーではないですよ
完全長なcDNAのことです
cDNAライブラリー≒完全長cDNAライブラリーと言えばいいかな

(無題) 削除/引用
No.2897-2 - 2010/07/16 (金) 13:01:21 - ザンギ
部分配列が分かってないのに、完全長cDNAをとろうとしているのですか?
遺伝子の同定はどうするつもりですか?

CAPサイトからポリAまでを1クローンの中に含む完全長cDNAをライブラリーとして
作ることは技術的には可能ですが、貴方が欲しい遺伝子のクローンをどうやって
選び出すのでしょうか?

特定の未知遺伝子の完全長cDNAをとりたいのであれば、部分配列をまず決めた上
でRACEして上下に伸ばすのが定法ではないでしょうか。

完全長cDNA 削除/引用
No.2897-1 - 2010/07/16 (金) 12:06:25 - kitanokunikara
完全長cDNAをとりたいと思っている者です。
キットの説明書を読み比べても、インビトロジェンのGeneRacer、クローンマイナー、3'5'RACEシステムの違いが理解できません。
GeneRacerはGene-Specific Primerを使うようですが、GSPを作るための既知の配列がない場合は、GeneRacerは使えないのでしょうか?
クロンテックだったら、In-Fusion SMARTer cDNA library construction kit、SMART cDNA Library construction Kitあたりを考えているのですが・・・
皆様、どのような点でキットを比較されているのでしょうか?
また、完全長cDNA=cDNAライブラリーと考えていいのでしょうか?
初心者で的を得ていないことを書いているかもしれませんが、ご助言いただけると幸いです。
お願いします。

5件 ( 1 〜 5 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を