ある疾患を持つ動物の家系図から、疾患の遺伝様式を推定しています。家系図から、メンデルの常染色体性の劣性遺伝であることは容易に推定できます。
そこで、実際に尤度比を検定して、常染色体、単一遺伝子の劣性遺伝のモデルがフィットすることをテストしたいと考えています。
つまりやりたいことは、家系図の情報（家系分析）を使った
【Segregation analysis to determine the mode of inheritance】です。
jPAPというソフトを使うとできるようなのですが、オンラインマニュアルの一部が、当方のPCの設定ではどうしても読み込むことができず四苦八苦しています。
文献上では、それなりの引用件数のあるアプリですからフォーラムの読者の方に、使用経験がある方がいれば幸いです。
知りたいことは
Pedigree Data Editor を使って家系図を入力した後
どのように解析を走らせればよいかです。
家系図の入力までは完了しています。
遺伝モデルは常染色体性劣性遺伝とし、
あるのは血縁情報と発症・非発症のデータのみです。
http://hasstedt.genetics.utah.edu/
Sandra J. Hasstedt - Pedigree Analysis Software |
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