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過酸化水素、感受性試験
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No.2812-TOPIC - 2010/07/01 (木) 11:34:42 -
@_@
genotypeを変えた大腸菌と野生株を使用し、過酸化水素処理を施し、生存率を確認する実験を行っています。
初め、過酸化水素を20mMで1h、37℃で振盪して処理を行いました。
ポジコンで0mMのものを試し、その生存率をLBplateに散布して確認しましたが20mMではコロニーが生育しませんでした。
それではと3mM、5mMで処理しましたがそれでもコロニーは生育しません。
過去この濃度で処理を行った結果、幾つかコロニーが生育していたのですが、今回は0(ゼロ)でした。
今後検討していくこと↓
@菌体の回収吸光度を変更する(今回は0.4〜0.5)
A過酸化水素の濃度をもっと低くする
Bプレーティングの際、菌体を散布する濃度を濃くする
C過酸化水素処理時間を短くする(30min程度)
気になった方、もし良かったらご意見をください。
よろしくお願いします。
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No.2812-6 - 2010/07/02 (金) 14:38:39 -
@_@
>atsさん
回答有難うございます。
生存率は野生株で大体50%前後でしたが、時たまばらつきがみられます(それは手技誤差だと思います)OD1.0あたりのコロニー数は8乗ほどでした(過酸化水素処理していない菌体)。
>in situさん
有難うございます。
確かに以前の手法に準じるだけでは、何も解かりませんよね…
検討してみます。
(無題)
削除/引用
No.2812-5 - 2010/07/01 (木) 18:55:58 - in situ
薬剤濃度の条件検討の幅が狭すぎるように感じます。
>過去この濃度で処理を行った結果、幾つかコロニーが生育していたのですが
という時に、条件検討を行った結果この濃度を選択されたのかわかりませんが、とりあえずは野生株で10倍ずつ薬剤濃度を振って(10mM, 1mM, 100uM, 10uM, 1uM…, 死ななくなる濃度)生存率曲線を描いてみることをお勧めします。
(無題)
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No.2812-4 - 2010/07/01 (木) 18:32:51 -
ats
「幾つか」というのがどれくらいの生存率なのでしょうか?
菌株にもよりますが、OD=1のとき大腸菌数は10の8乗〜9乗/mlです。
薬剤処理した大腸菌液(菌体数10の8乗オーダー)を100uL蒔いて数個しかでないようなら、薬剤処理処理条件がきつすぎることだと思います。
生存率1/10000,1/1000,1/100,1/10くらいを与える薬剤処理条件を探して、野生株と実験株を比較したらいかがでしょうか。
過酸化水素、感受性試験
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No.2812-1 - 2010/07/01 (木) 11:34:42 -
@_@
genotypeを変えた大腸菌と野生株を使用し、過酸化水素処理を施し、生存率を確認する実験を行っています。
初め、過酸化水素を20mMで1h、37℃で振盪して処理を行いました。
ポジコンで0mMのものを試し、その生存率をLBplateに散布して確認しましたが20mMではコロニーが生育しませんでした。
それではと3mM、5mMで処理しましたがそれでもコロニーは生育しません。
過去この濃度で処理を行った結果、幾つかコロニーが生育していたのですが、今回は0(ゼロ)でした。
今後検討していくこと↓
@菌体の回収吸光度を変更する(今回は0.4〜0.5)
A過酸化水素の濃度をもっと低くする
Bプレーティングの際、菌体を散布する濃度を濃くする
C過酸化水素処理時間を短くする(30min程度)
気になった方、もし良かったらご意見をください。
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