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beta-Galプラスミド増幅 トピック削除
No.2807-TOPIC - 2010/06/30 (水) 13:46:56 - 東海岸ポスドク
いつもお世話になっております。
新しく着任したラボにてbeta-galactosidaseのプラスミドの増幅を行っています。
大腸菌DH-5aもしくはMach1にトランスフォーメーションし、単独コロニーをピックアップ、100mlのLB培地に100ulのアンピシリンを加え、overnightでcultureし、Qiagenのmidiprep、と通常の手順で行っています。しかし、コロニーは生えるし、大腸菌は増えるのですが、プラスミドの収量が極端に少ないのです。せいぜい数マイクログラムしか取れていません。同時に行った他のプラスミドのmidiprepでは100マイクログラム以上とれているので、方法自体は間違えていないと思っています。overgrowthを疑い、短めの時間でのcultureにもtryしたのですが、それでも取れませんでした。大腸菌の株を変え、LB以外にも2xYT培地を試し、smart ampicillingを使う、抗生剤を少し増やすなどいろいろと工夫しているのですが、それでも取れません。後はcultureの温度を下げるぐらいしか思いつかない状況です。何かよい方法がありましたらご教授頂けますと幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.2807-4 - 2010/06/30 (水) 21:05:47 - take_
いろいろ理由はあるらしい。

http://www.brc.riken.jp/lab/dna/ja/news/NWL070804.html

(無題) 削除/引用
No.2807-3 - 2010/06/30 (水) 14:20:17 - 通りがかり
ちなみに、lacZ ベクターとしてよく使われる pCH110 は pBR322 由来で low copy ですよ。

(無題) 削除/引用
No.2807-2 - 2010/06/30 (水) 14:04:33 - 通りがかり
単に low copy plasmid であるというオチは?

beta-Galプラスミド増幅 削除/引用
No.2807-1 - 2010/06/30 (水) 13:46:56 - 東海岸ポスドク
いつもお世話になっております。
新しく着任したラボにてbeta-galactosidaseのプラスミドの増幅を行っています。
大腸菌DH-5aもしくはMach1にトランスフォーメーションし、単独コロニーをピックアップ、100mlのLB培地に100ulのアンピシリンを加え、overnightでcultureし、Qiagenのmidiprep、と通常の手順で行っています。しかし、コロニーは生えるし、大腸菌は増えるのですが、プラスミドの収量が極端に少ないのです。せいぜい数マイクログラムしか取れていません。同時に行った他のプラスミドのmidiprepでは100マイクログラム以上とれているので、方法自体は間違えていないと思っています。overgrowthを疑い、短めの時間でのcultureにもtryしたのですが、それでも取れませんでした。大腸菌の株を変え、LB以外にも2xYT培地を試し、smart ampicillingを使う、抗生剤を少し増やすなどいろいろと工夫しているのですが、それでも取れません。後はcultureの温度を下げるぐらいしか思いつかない状況です。何かよい方法がありましたらご教授頂けますと幸いです。

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