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NHS反応 トピック削除
No.2740-TOPIC - 2010/06/17 (木) 16:59:25 - でる
あるタンパク質をNHS反応でPEG修飾したいと考えております。説明にはリジン残基(イプシロンアミノ基)もしくはN末端アミノ基と反応するとなっているのですが、アルギニンやアスパラギン、グルタミンなどのNH2基を持ったアミノ酸残基とは反応しないのでしょうか?

完全に素人丸出しの質問で申し訳ありませんが、どなたか教えていただけると嬉しいです。宜しくお願いします。
 
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No.2740-5 - 2010/06/28 (月) 14:49:00 - でる
a様

補足説明有難うございます。

アルギニンとリジンでは、側鎖の電離の仕方が違うのですね。自分が使用しようとしているタンパク質がアルギニンRichなもので、予定外な反応(アルギニン残基にNHSが持っていかれる)を起してしまうのではないかと心配でした。

しかし、NHSにチオールが反応するかもしれないのですね。ちょっとそちらも気になります。マニュアル等調べてみます。

有難うございました。

(無題) 削除/引用
No.2740-4 - 2010/06/26 (土) 18:01:47 - a
もう見てないかもしれませんが...APさんの補足から。
塩基性と求核性はイコ−ルではありません。
アルギニン末端のグアニジニウム基はプロトン化し共役して+チャージを持ちます。

NHSエステルが反応するのは基本的に1級アミンで、かつ電荷をもたない状態においてです。
チオールも反応したかもしれません。
バイオ向け化学の教科書やPierceのカタログや関連書籍等を参照してください。

(無題) 削除/引用
No.2740-3 - 2010/06/21 (月) 11:50:59 - でる
AP様

丁寧な解説ありがとうございます。
同じようなNH2基でも電離具合が違うのですね。基本的な化学を勉強する必要がありそうです。

失礼いたしました。

(無題) 削除/引用
No.2740-2 - 2010/06/18 (金) 21:47:38 - AP
生化学は得意ではないですが、授業で習う程度の知識で説明できそうです。

生化学の教科書にアミノ酸の分類と側鎖の構造式が出ていましょう?
Lysの側鎖は電離・極性型、塩基性で、多くの場合、構造式は-NH3+と表されているはずです。

それにたいして、Asn、Glnは非電離・極性型で、極性は>C=O基に因ります。
末端-NH2基は電離しませんので(おそらく、C-Nの結合がC=Oの二重結合と共鳴状態で二重結合相当になっているため?)、構造式は-NH2になっているはずです。Argは電離・極性型、塩基性ですが、電離するのは末端-NH2基ではありません。

Lysの末端とは性質が異なるということですね。

NHS反応 削除/引用
No.2740-1 - 2010/06/17 (木) 16:59:25 - でる
あるタンパク質をNHS反応でPEG修飾したいと考えております。説明にはリジン残基(イプシロンアミノ基)もしくはN末端アミノ基と反応するとなっているのですが、アルギニンやアスパラギン、グルタミンなどのNH2基を持ったアミノ酸残基とは反応しないのでしょうか?

完全に素人丸出しの質問で申し訳ありませんが、どなたか教えていただけると嬉しいです。宜しくお願いします。

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