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リアルタイムPCRの結果からS.E.とS.D.を算出する方法 トピック削除
No.252-TOPIC - 2009/03/30 (月) 16:15:25 - ものさし
今、リアルタイムPCR(相対定量)を行っていますが、私のS.E.とS.D.の算出方法が正しいのかわかりません。そこで、いろいろご教授頂ければ幸いです。
私の実験では、処理区と無処理区を設けて、それぞれ3個体サンプリングしています。そして、リアルタイムPCRを用いて処理区と無処理区のリファレンス遺伝子と目的遺伝子の量を検量線から算出しています。その後、リファレンス遺伝子で補正すると、処理区あたり、3つ(N=3)のデーターがでます。そのとき、例えば、補正した値が無処理区では343.4(sample no.1),220.8(sample no.2),180.2(sample no.3)で,処理区では,600.8(sample no.1),400.8(sample no.2),830.2(sample no.3)だったとします。その際、無処理区のsample no.1を1とすると、無処理区のsample no.2では0.64,sample no.3では0.52、処理区のsample no.1では1.75,sample no.2では1.17,sample no.3では2.42となると思います。そして、この値を使ってそれぞれの処理区のS.E.とS.D.を算出していますが、これは正しい方法でしょうか?ご存知の方がいらっしゃいましたら教えて頂けないでしょうか?
 
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「正しい方法」とは? 削除/引用
No.252-3 - 2009/04/01 (水) 16:11:25 - mom-a
何がしたいのか、あなたが間違っているかも、と気にしているのは具体的にどの部分なのか、どうもよくわからないので、答えようがないのではないでしょうか。

A)343.4, 220.8, 180.2と600.8, 400.8, 830.2
B)1, 0.64, 0.52と1.75, 1.17, 2.42
A,Bそれぞれの平均値、S.D.、S.E.は計算してみましたよね?それらの数値の関係はどうなっていますか?

そこを確認した上で、ものさしさんが不安に思うのは、どんなことでしょうか?それとも、純粋に数学的な問題ではなく、「リアルタイムPCRのデータ解析の場合」の場合に固有の問題についての質問でしょうか?

書き忘れました。 削除/引用
No.252-2 - 2009/03/30 (月) 16:17:47 - ものさし
また、自分でも勉強したいと思っていますので参考になる本や文献がありましたら紹介して頂けないでしょうか?よろしくお願い致します。

リアルタイムPCRの結果からS.E.とS.D.を算出する方法 削除/引用
No.252-1 - 2009/03/30 (月) 16:15:25 - ものさし
今、リアルタイムPCR(相対定量)を行っていますが、私のS.E.とS.D.の算出方法が正しいのかわかりません。そこで、いろいろご教授頂ければ幸いです。
私の実験では、処理区と無処理区を設けて、それぞれ3個体サンプリングしています。そして、リアルタイムPCRを用いて処理区と無処理区のリファレンス遺伝子と目的遺伝子の量を検量線から算出しています。その後、リファレンス遺伝子で補正すると、処理区あたり、3つ(N=3)のデーターがでます。そのとき、例えば、補正した値が無処理区では343.4(sample no.1),220.8(sample no.2),180.2(sample no.3)で,処理区では,600.8(sample no.1),400.8(sample no.2),830.2(sample no.3)だったとします。その際、無処理区のsample no.1を1とすると、無処理区のsample no.2では0.64,sample no.3では0.52、処理区のsample no.1では1.75,sample no.2では1.17,sample no.3では2.42となると思います。そして、この値を使ってそれぞれの処理区のS.E.とS.D.を算出していますが、これは正しい方法でしょうか?ご存知の方がいらっしゃいましたら教えて頂けないでしょうか?

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