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Red/ET Recombination System BAC SUBCLONING Kitについて トピック削除
No.2499-TOPIC - 2010/05/03 (月) 13:37:58 - ATG
 Gene bridge社からでているRed/ET Recombination System BAC SUBCLONING Kitを使用されたことのある方、是非教えてください。

 現在、このキットを用いてtargeting vectorを作成しようとしているのですが、うまくいきません。キットについているpositive controlでは30%の確率でrecombinationされるのに、私の目的のBACは何度やってもrecombinationされませんでした。primerも何度も確かめ、テクニカルサポートセンターとのやりとりで間違っていなさそうなのですが、どこかおかしいのかもしれません。
 実際に、私のやる方法ではPCR productのエレクトロポレーション後にコロニーがあまり生えないので、少しおかしいのかなと思っております。

 そこで情報をいただきたいのは、

 @だいたい皆さんはどれくらいのrecombination効率でBACのサブクローニングに成功されていますか?
 ApRed/ET vectorのelectroporationの後、プレートを保存できないという噂を聞いたのですが、本当でしょうか。
 Bうまくいかなかったとき、どこを改善すればうまくいきましたか?

 何卒よろしくお願いいたします!!
 
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(無題) 削除/引用
No.2499-3 - 2010/05/06 (木) 10:51:46 - ATG
 >あべちゃんさん

 コメントありがとうございます。
 プラスミドの精製というのはPCR productsのことでしょうか。
 この精製に関しましては、アガロース電気泳動の後、切り出した後、通常のエタ沈で濃縮しております。塩濃度に関しましてはどれくらい残っているのかは分かりません。次からは70%エタノールで2回洗うことにしてみます。

 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.2499-2 - 2010/05/04 (火) 19:13:27 - あべちゃん
>[Re:1] ATGさんは書きました :

>  @だいたい皆さんはどれくらいのrecombination効率でBACのサブクローニングに成功されていますか?
>  ApRed/ET vectorのelectroporationの後、プレートを保存できないという噂を聞いたのですが、本当でしょうか。
>  Bうまくいかなかったとき、どこを改善すればうまくいきましたか?

レスが付かないようなので、余り経験無いのですが、

5kb程度のプロモーターをクローニングするくらいしか、経験有りませんが特に問題なかったです。1/8くらいの確率だったと思います。

ポジコンでは上手くいっているようなので、大腸菌の洗いやアラビノースによる誘導など全般は上手くいっているのでしょうね。配列も問題ないとすれば、

受け手プラスミドの精製度はどうでしょう?エレポのときって、塩などの夾雑物を嫌いますよね。

それくらいしか思い浮かびませんでした。

Red/ET Recombination System BAC SUBCLONING Kitについて 削除/引用
No.2499-1 - 2010/05/03 (月) 13:37:58 - ATG
 Gene bridge社からでているRed/ET Recombination System BAC SUBCLONING Kitを使用されたことのある方、是非教えてください。

 現在、このキットを用いてtargeting vectorを作成しようとしているのですが、うまくいきません。キットについているpositive controlでは30%の確率でrecombinationされるのに、私の目的のBACは何度やってもrecombinationされませんでした。primerも何度も確かめ、テクニカルサポートセンターとのやりとりで間違っていなさそうなのですが、どこかおかしいのかもしれません。
 実際に、私のやる方法ではPCR productのエレクトロポレーション後にコロニーがあまり生えないので、少しおかしいのかなと思っております。

 そこで情報をいただきたいのは、

 @だいたい皆さんはどれくらいのrecombination効率でBACのサブクローニングに成功されていますか?
 ApRed/ET vectorのelectroporationの後、プレートを保存できないという噂を聞いたのですが、本当でしょうか。
 Bうまくいかなかったとき、どこを改善すればうまくいきましたか?

 何卒よろしくお願いいたします!!

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