Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

レポーターアッセイのコンストラクト トピック削除
No.2487-TOPIC - 2010/04/30 (金) 01:26:55 - 何年たっても素人
いつも大変参考にさせて頂いております。

最近、promega社のDual-Luciferase(R) Reporter Assay System
を用いてレポーターアッセイを行っています。
ある遺伝子のプロモーター領域をクローニングして
pGL3-basic vectorに挿入しようとしたのですが、
そのクローニング領域を1st exon上流約2000bpから
1st intron 約200bpまでとしてしまいました。
後で先輩からintronまで含めると、splicingが働き
レポーターアッセイとして機能しないことがあると聞きました。
実際にアッセイを行うとコントロールとしてpGL-basic vectorを用いた場合と比べ、約50〜100倍ほどのluciferase活性が得られており、
それなりには機能しているとは思っているのですが、正確を期す為には
intronを含まないコンストラクトに作り替えたほうが良いでしょうか?

大変初歩的な質問で恐れ入りますが
何とぞ御教示お願い致します。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2487-4 - 2010/05/04 (火) 19:53:02 - あいうえお
Exと1st Intronからの転写制御はエンハンサー的に働くと思います。
教科書的には、場所や向きは問われないので、例えば、ルシフェラーゼ遺伝子の
後ろに気になる配列をいれてしまうのも手かと。
イントロンのエンハンサー活性を調べている論文をいくつか調べてみては?

(無題) 削除/引用
No.2487-3 - 2010/04/30 (金) 08:49:47 - ???
>後で先輩からintronまで含めると、splicingが働き
レポーターアッセイとして機能しないことがあると聞きました。

機能しないときに考えることでは?
詳しい結果を見ていない他人が、

>際にアッセイを行うとコントロールとしてpGL-basic vectorを用いた場合と比べ、約50〜100倍ほどのluciferase活性が得られており、
それなりには機能しているとは思っているのですが、

とある書き込み以上の情報がないのに、作り替えた方がいいかどうかなんて
わからないです。

(無題) 削除/引用
No.2487-2 - 2010/04/30 (金) 07:09:56 - ats
intronにも転写活性「等」を制御する配列が含まれていることが多いので、intronを加えるのは問題ありません。むしろ好ましいでしょう。
しかし、正常にsplicingが起きるように組み込む必要があります。
具体的には、挿入した配列にはintron donor(exon-intron境界配列)がありますが、対になるintron acceptor(intron-exon(luciferase)境界配列)はありますか?
もし無いようなら、luciferaseコード領域の前に30bpほどの人工の共通配列を組み込んでください。

レポーターアッセイのコンストラクト 削除/引用
No.2487-1 - 2010/04/30 (金) 01:26:55 - 何年たっても素人
いつも大変参考にさせて頂いております。

最近、promega社のDual-Luciferase(R) Reporter Assay System
を用いてレポーターアッセイを行っています。
ある遺伝子のプロモーター領域をクローニングして
pGL3-basic vectorに挿入しようとしたのですが、
そのクローニング領域を1st exon上流約2000bpから
1st intron 約200bpまでとしてしまいました。
後で先輩からintronまで含めると、splicingが働き
レポーターアッセイとして機能しないことがあると聞きました。
実際にアッセイを行うとコントロールとしてpGL-basic vectorを用いた場合と比べ、約50〜100倍ほどのluciferase活性が得られており、
それなりには機能しているとは思っているのですが、正確を期す為には
intronを含まないコンストラクトに作り替えたほうが良いでしょうか?

大変初歩的な質問で恐れ入りますが
何とぞ御教示お願い致します。

4件 ( 1 〜 4 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を