Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧　|　研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム　|　このフォーラム　|　ひとつ前のフォーラム（readのみ）

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

マウスのストレイン間でのSNPの探し方 トピック削除
No.2469-TOPIC - 2010/04/26 (月) 23:25:49 - あかね
SNPsにうといのでアドバイスお願いします。

現在、マウスのある遺伝子がmonoallelicな発現をしていることを見いだしました。どちら（母親、父親）の染色体から発現しているのかを確認すべく、その遺伝子上にあるSNPsを利用して、どちらから発現しているのか確認しようと思っています。
今のところ、手順としては
01. SNPsデータベースから目的遺伝子上のSNPs（マウスのストレイン間）を探し出す。
02. 異なるストレインのマウスを交配する。
03. SNPsを含む領域をRT-PCRで増やし、シークエンスあるいはSSCPで、どちらの染色体由来なのかを特定する。

そこで、01のステップについてですが、マウスのSNPsを探すサイト、手順、注意点等を教えていただけないでしょうか？

宜しくお願いします。
　
- このトピックにメッセージを投稿する -



全2件 ( 1 〜 2 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用
No.2469-2 - 2010/04/27 (火) 16:03:27 - -
BALBとB6でSNPsがあるのなら、CXBを使うことができるのではないでしょうか。

マウスのストレイン間でのSNPの探し方 削除/引用
No.2469-1 - 2010/04/26 (月) 23:25:49 - あかね
SNPsにうといのでアドバイスお願いします。

現在、マウスのある遺伝子がmonoallelicな発現をしていることを見いだしました。どちら（母親、父親）の染色体から発現しているのかを確認すべく、その遺伝子上にあるSNPsを利用して、どちらから発現しているのか確認しようと思っています。
今のところ、手順としては
01. SNPsデータベースから目的遺伝子上のSNPs（マウスのストレイン間）を探し出す。
02. 異なるストレインのマウスを交配する。
03. SNPsを含む領域をRT-PCRで増やし、シークエンスあるいはSSCPで、どちらの染色体由来なのかを特定する。

そこで、01のステップについてですが、マウスのSNPsを探すサイト、手順、注意点等を教えていただけないでしょうか？

宜しくお願いします。
全2件 ( 1 〜 2 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を