Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

最新のフォーラム | このフォーラム | ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

シークエンス解析について トピック削除
No.2451-TOPIC - 2010/04/23 (金) 13:55:44 - agri
先日DNAのシークエンス解析を行いました。
結果が、出て配列を分析しようと思いましたが、機械が出してくれた配列は、相補配列として出てくるのでしょうか?
つまり、用いたプライマーがAGTCならば、AGTCという配列スタートで表示されるのでしょうか?
あるいは、最後の部分がTCAGとして表示されるのでしょうか?

初歩的な質問ですが、どうぞよろしくお願いいたします。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 削除/引用
No.2451-3 - 2010/04/23 (金) 17:00:12 - 5'-sequence-3'
大抵、プライマーが5'-AGTC*******-3'ならAGTC****の方向に読まれていきます。ついでに私が使っているシークエンサーはプライマーの50bpぐらい3'方向に進んだところから読まれ始めます。

(無題) 削除/引用
No.2451-2 - 2010/04/23 (金) 14:44:37 - ~
相補鎖に変換してくれる設定を見たことがありませんが、
あなたの場合はその設定があり、使っているかもしれません。

貴方の使っているシークエンサーのマニュアルと解析ソフトの設定を見ないかぎりは、
貴方が得た情報がどちらなのかを確認することは出来ないのでは?

シークエンス解析について 削除/引用
No.2451-1 - 2010/04/23 (金) 13:55:44 - agri
先日DNAのシークエンス解析を行いました。
結果が、出て配列を分析しようと思いましたが、機械が出してくれた配列は、相補配列として出てくるのでしょうか?
つまり、用いたプライマーがAGTCならば、AGTCという配列スタートで表示されるのでしょうか?
あるいは、最後の部分がTCAGとして表示されるのでしょうか?

初歩的な質問ですが、どうぞよろしくお願いいたします。

3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を