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(無題) 削除/引用 No.210-8 - 2009/03/20 (金) 00:58:54 - norua 名無し様 紹介して頂いたhpdrに早速アクセスしてみました。アクセッションナンバーを入力したら、やはりTNF系の分子らしいですが、相互分子（interaction)は無いとのことです。やはり、自力で同定するのが良いかと思っております。

さっきの補足 削除/引用 No.210-7 - 2009/03/19 (木) 21:51:22 - 名無し 蛋白質の名前は略号で入れないとダメみたい。フルネームだと拒否された。その蛋白質の正式な略号知ってる？

(無題) 削除/引用 No.210-6 - 2009/03/19 (木) 21:47:37 - 名無し 見つけた。ここ。http://www.hprd.org/ 左側のカラムの一番上のQueyから入って、蛋白質の名前入れて, それで下のsearchをクリック。

(無題) 削除/引用 No.210-5 - 2009/03/19 (木) 21:26:15 - A アミノ酸配列の相同性からTNFファミリーに属しているのではないかと 想像されているということですが、TNFファミリー分子と言えばFas リガンドやCD40リガンドがありますからnoruaさんが同定しようとして いるのは現在機能解析している分子の受容体ですか？それとも書き 間違いで解析しようとしている分子がTNFファミリーの受容体と相同性 があってそのリガンドを同定しようとしているということですか？

(無題) 削除/引用 No.210-4 - 2009/03/19 (木) 19:35:56 - norua C様 ＞一番よいのは実際にそのリガンドを単離精製して構造を調べてみればTNFファミリーかそうでないかがわかるのではないかとおもいます。インターラクションのパートナーを探す方法はすでにいろいろ報告がありますので、やれることもまたいろいろあると思います。 御返信ありがとうございます。現在、その分子のリガンドがある特定の細胞集団に出ているのではないかという段階でして、未だそのリガンド同定には至っていない状況です。 名無し様 そのような便利なサイトがあるんですね。自分でも検索してみます。

(無題) 削除/引用 No.210-3 - 2009/03/19 (木) 18:24:09 - 名無し 蛋白質の名前入れて、interactionというとことクリクするとインターラクションする可能性のある蛋白質のリストとみたいのがダーッと出て、どういう方法でそういえるか（酵母２ハイブリドしましたとかin　vivoとか書いてあった）というのも横に書いてあって、それ以外にも修飾部位とかその蛋白質の関わる病気とかそういうデータも選択するとそれもみれるサイトが前あったのですがいま見つかりません。そういうところみればなんか分かると思うので知ってる人教えてあげてください。全体に白っぽいくて一部オレンジというか黄色っぽい感じの配色のサイトでした。

(無題) 削除/引用 No.210-2 - 2009/03/19 (木) 17:32:51 - C 一番よいのは実際にそのリガンドを単離精製して構造を調べてみればTNFファミリーかそうでないかがわかるのではないかとおもいます。インターラクションのパートナーを探す方法はすでにいろいろ報告がありますので、やれることもまたいろいろあると思います。

分子間相互作用について 削除/引用 No.210-1 - 2009/03/18 (水) 23:10:57 - norua お世話になっております。疑問に思ったことがありましたので、 質問させていただきます。 私は学生で、現在ある分子に対するリガンドを取ろうとしています。 その分子はかなりマイナーな分子で、殆ど機能解析がされてい ないのですが（そのため私がやっています）、アミノ酸配列から TNFファミリーにいるようです。そこで、文献等で互いに相互作用する 分子について調べたのですが、同じファミリー同士が相互作用している ケースが多いということに気づきました。たとえば、イムノグロブリン ファミリーに属するCD28は同じイムノグロブリンファミリーのCD80や CD86と結合します。 ということは、私が探している分子はTNFファミリーに属している可能性が高いのでしょうか？ よろしくお願い致します。

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