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ありがとうございます 削除/引用 No.1833-5 - 2010/01/04 (月) 12:45:42 - m コメントありがとうございます。 シークエンスできれいな結果がでていれば、いいのですが・・・・ PolyAのある前or後はきれいにでてます。 PolyAの部分をうまく出す方法があるのでしょうか？ Primerの位置等、もう一度検討してみます。

(無題) 削除/引用 No.1833-4 - 2010/01/04 (月) 11:52:20 - SNP Aがheteroで1塩基だけ欠失もしくは挿入されている可能性はいかがですか。逆から読んでも、同様にA以降が「ぐちゃぐちゃ」というか、1塩基ずつずれて重なっていればわかるかと思うのですが。

(無題) 削除/引用 No.1833-3 - 2009/12/28 (月) 19:21:37 - リバースだけ わたしなら、データがクリアならリバースだけで満足します。 また、フォアードの位置を十分上流に動かしてはいかがですが？

(無題) 削除/引用 No.1833-2 - 2009/12/28 (月) 18:38:43 - おお dGTP BigDye™ Terminator Cycle Sequencing FS Ready Reaction Kit http://www.appliedbiosystems.jp/website/jp/product/modelpage.jsp?BUCD=130&PLCD=127&MODELCD=205&MODELPGCD=206 これを使うとGTリッチとか、2次構造が問題な時に 改善されることがあるようです。

シークエンスでAがつづく配列を確認したいとき 削除/引用 No.1833-1 - 2009/12/28 (月) 16:57:36 - m お世話になります。 ある遺伝子の解析を行っています。 Ex9の配列をみたいため、primerを設計し、遺伝子解析を行っていますが、 Fowardが何度やっても、読めません。riverseは読めます。 Ex9より50塩基前のイントロンから14個の塩基A(Poly　A)がつづきます。その(PolyA)の前にPrimerを設定しているために、それ以降が読めない可能性があると考えていますが、こんな場合にきちんとシークエンスする方法はありますか？ Riverse　もこのPoyA以降は波がぐちゃぐちゃになっています。(Exonは読めてますが・・・) intronの中のことなので、Exonに異常なければ、問題ないとおもいますが、 このような場合どうせればよいかおしえてください。 たとえばAの14塩基内にさらにAの挿入があったり、した場合などはどうなるのかと思いまして・・・ 配列は以下のような感じです。 （Foward　Primer)TATCTTAAAA AAAAAAAAAA GGTCTATTGT CTTAATTATTCTATTTTGCT TTTTAG-(Exon9)-(iniron　101塩基)-(Riverse　primer）

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