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遺伝子配列の検索について トピック削除
No.1820-TOPIC - 2009/12/25 (金) 10:39:35 - ship
いつも大変お世話になっております。

遺伝子配列の検索についてお教えください。

遺伝子配列の検索をNCBIで行っていたところ,
transscript variant ○○○,mRNA とあります。

○○○をシークエンスしたいのですが,transscript variantの遺伝子配列しか掲載されていないようなのですが…。

あと,mRNAの配列はゲノムから問題なくシークエンスされるのでよろしいのでしょうか?

お忙しいところ誠に申し訳ありませんが,ご教授の程宜しくお願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.1820-3 - 2009/12/25 (金) 13:21:52 - おお
>[Re:1] shipさんは書きました :

> 遺伝子配列の検索をNCBIで行っていたところ,
> transscript variant ○○○,mRNA とあります。
>
> ○○○をシークエンスしたいのですが,transscript variantの遺伝子配列しか掲載されていないようなのですが…。

バリアントの意味を理解されてないのか、単に探し方が
悪いのか、、、
http://www.ensembl.org/index.html
ENSEMBLで遺伝子見つけてそのトランスクリプトをみたほうがいい
のでは。


>
> あと,mRNAの配列はゲノムから問題なくシークエンスされるのでよろしいのでしょうか?

イントロンを含んでいるという理解のもとにそうおっしゃっているなら
ほぼ間違えありません。ただしエディッティングで塩基が代わったり
ごくまれにゲノムから予想しにくいことがおこることがあります。
mRNAの配列が報告されているなら、そのへんは見れば分かると思います。

(無題) 削除/引用
No.1820-2 - 2009/12/25 (金) 11:29:12 - みみ
質問の意味が全く分かりません。

>○○○をシークエンスしたい

クローニングしたいという意味ですか?

>mRNAの配列はゲノムから問題なくシークエンスされる

ゲノムからクローニングしたいということですか? イントロンが無い場所ならいけるでしょう。

禅問答みたい(笑)

遺伝子配列の検索について 削除/引用
No.1820-1 - 2009/12/25 (金) 10:39:35 - ship
いつも大変お世話になっております。

遺伝子配列の検索についてお教えください。

遺伝子配列の検索をNCBIで行っていたところ,
transscript variant ○○○,mRNA とあります。

○○○をシークエンスしたいのですが,transscript variantの遺伝子配列しか掲載されていないようなのですが…。

あと,mRNAの配列はゲノムから問題なくシークエンスされるのでよろしいのでしょうか?

お忙しいところ誠に申し訳ありませんが,ご教授の程宜しくお願いいたします。

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