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ペプチドマップ
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No.1811-TOPIC - 2009/12/22 (火) 21:56:07 -
まっぷ
今、ペプチドマップに取り掛かっているんですが、アミノ酸配列から察すると約40本のペプチドが生成されます。
分離条件は酸性条件下で行ない、カラムはODSカラムを使ってます。
ペプチドの保持時間はペプチドの長短によってではなく、おそらく糖鎖の付加も影響するでしょう。
得られるペプチドの順序を推定するソフトウエアや、各ペプチドの疎水性を観察するツールなどペプチドマップを行なうにあたって便利なツールをご存知の片は是非教えて下さい。
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No.1811-3 - 2009/12/24 (木) 07:37:28 -
まっぷ
おおさん
アドバイス、ありがとうございます。
> イオン交換カラムの方が挙動を想像しやすいのでは
そうですね。
大体で良いから把握できればという感じですが、
分離には色々なファクターがありすぎて・・・
なかなか難しいものです。
もう暫し、考えます。
(無題)
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No.1811-2 - 2009/12/24 (木) 04:01:26 -
おお
逆そうカラムの挙動については詳しくありませんが、
イオン交換カラムの方が挙動を想像しやすいのではと
思ったのですが、いかがなもんでしょう。
ペプチドマップ
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No.1811-1 - 2009/12/22 (火) 21:56:07 -
まっぷ
今、ペプチドマップに取り掛かっているんですが、アミノ酸配列から察すると約40本のペプチドが生成されます。
分離条件は酸性条件下で行ない、カラムはODSカラムを使ってます。
ペプチドの保持時間はペプチドの長短によってではなく、おそらく糖鎖の付加も影響するでしょう。
得られるペプチドの順序を推定するソフトウエアや、各ペプチドの疎水性を観察するツールなどペプチドマップを行なうにあたって便利なツールをご存知の片は是非教えて下さい。
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