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Fast PCR対応Master Mixは何がちがう? トピック削除
No.1782-TOPIC - 2009/12/19 (土) 03:33:27 - くり
興味本位の質問なのですが、Applied Biosystemの9500 Fastや7900HTはFast modeで走らすときはFast mode対応のPCR Master Mixを使うこととなっています。この、Fast mode対応というのはどのような成分が違うのでしょうか?

Fast modeといっても、95℃ 3 sec, 60℃ 30 secのサイクルですから、普通のPCR mixでも十分はたらく気もするのですが・・・。それとも 60℃でのextensionというのは普通の条件では低すぎて、短時間で延ばすのになにかバッファーに工夫が施されているということなのでしょうか?
 
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No.1782-4 - 2009/12/21 (月) 17:44:38 - たんぱく
ポリメラーゼの量なのかなと思ってたりしてます。

プライムスターとかバイオラッドとかフュージョンとかのポリメラーゼの
マニュアルには、エクステンションを短くしたいときは
酵素量を増やせと記述があったと記憶しています。
私の感覚だと、酵素量を増やしてエクステンションを短くしても
わりといく感じです。ただ、微妙な増幅とかだとこれをしても
だめな可能性が高い気がします。たった数時間、通常通りやったほうが
よさそうです。

(無題) 削除/引用
No.1782-3 - 2009/12/20 (日) 22:28:05 - 初心者
便乗質問なんですが、FASTと通常の反応では違いが時間以外にあるのですか?
なんとなくですが、時間短縮を考えた試薬は、どうしても反応効率や再現性の低下が疑われてしまいます。
どなたか、比べた方はいませんか?
もしいれば教えてください。

(無題) 削除/引用
No.1782-2 - 2009/12/19 (土) 23:01:55 - 業者A
ABIに聞けば

Fast PCR対応Master Mixは何がちがう? 削除/引用
No.1782-1 - 2009/12/19 (土) 03:33:27 - くり
興味本位の質問なのですが、Applied Biosystemの9500 Fastや7900HTはFast modeで走らすときはFast mode対応のPCR Master Mixを使うこととなっています。この、Fast mode対応というのはどのような成分が違うのでしょうか?

Fast modeといっても、95℃ 3 sec, 60℃ 30 secのサイクルですから、普通のPCR mixでも十分はたらく気もするのですが・・・。それとも 60℃でのextensionというのは普通の条件では低すぎて、短時間で延ばすのになにかバッファーに工夫が施されているということなのでしょうか?

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