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タンデムGFP トピック削除
No.1766-TOPIC - 2009/12/15 (火) 22:54:50 - あかね
論文等でタンデムにGFPをつないだコンストラクトを見かけます。
作成の際の注意点等ありますでしょうか?
EGFPではなくturboGFPの3x tandemコンストラクトを作成しようかと思っています。
気になっているのは、GFP間のリンカーの有無・配列とTurboGFPがdimerを形成することです。
通常はmonomerのGFPがよく使われていますが、dimerを形成するようなGFPでも問題ないかと、
心配しています。
 
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(無題) 削除/引用
No.1766-5 - 2009/12/16 (水) 17:34:58 - あかね
おお様、~様
コメントありがとうございます。
紹介してくださったものも含めいくつかリンカーに関する論文を見つけました。

(無題) 削除/引用
No.1766-4 - 2009/12/16 (水) 09:06:36 - ~
タンデムリピートは大腸菌内でデリーションを起こす可能性があります。
Stbl2やSuReなどの不安定なベクター向けの株を使った方が、トラブルが少ないかもしれません。

(無題) 削除/引用
No.1766-3 - 2009/12/16 (水) 06:50:28 - おお
>[Re:2] おおさんは書きました :

>
> FRETの文献で確かリンカーの長さとダイマーになる様子を
> 示した文献とかあったと思います。
> Analytical Biochemistryとかにも発表されていたと
> おもいます(ほかにもあるでしょうけど)。

あ、これです。
リンカーは10程度のアミノ酸から見ています。PCRのプライマーに
制限酵素用タグ、プラスアルファーあれば何とかなるようなきがします。

http://www.sciencedirect.com/science?_ob=ArticleURL&_udi=B6W9V-45CWN4M-8&_user=1458830&_rdoc=1&_fmt=&_orig=search&_sort=d&_docanchor=&view=c&_acct=C000052790&_version=1&_urlVersion=0&_userid=1458830&md5=e09ef62fcd01d27f761302b38f0e76dd

Analytical Biochemistry
Volume 296, Issue 2, 15 September 2001, Pages 208-217

A Method to Measure the Interaction of Rac/Cdc42 with Their Binding Partners Using Fluorescence Resonance Energy Transfer between Mutants of Green Fluorescent Protein

Debbie L. Graham, Peter N. Lowe and Peter A. Chalk

(無題) 削除/引用
No.1766-2 - 2009/12/16 (水) 02:48:18 - おお
FRETでダイマーになるのをりようすることがあります。
ダイマーの状態でもれいき、蛍光の特性が大きく変わらない
ので、FRETが起こる時の状態がモノマーの状態の特性で
説明できています。

FRETの文献で確かリンカーの長さとダイマーになる様子を
示した文献とかあったと思います。
Analytical Biochemistryとかにも発表されていたと
おもいます(ほかにもあるでしょうけど)。

目的はフレットではないでしょうけど参考になればと
おもいました。

タンデムGFP 削除/引用
No.1766-1 - 2009/12/15 (火) 22:54:50 - あかね
論文等でタンデムにGFPをつないだコンストラクトを見かけます。
作成の際の注意点等ありますでしょうか?
EGFPではなくturboGFPの3x tandemコンストラクトを作成しようかと思っています。
気になっているのは、GFP間のリンカーの有無・配列とTurboGFPがdimerを形成することです。
通常はmonomerのGFPがよく使われていますが、dimerを形成するようなGFPでも問題ないかと、
心配しています。

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