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遺伝子配列の検索について 削除/引用 No.1747-4 - 2009/12/11 (金) 20:17:35 - ship おおさん，ザンギさんご返事ありがとうございます。 参考にさせていただき，もっと勉強させていただきます。

(無題) 削除/引用 No.1747-3 - 2009/12/11 (金) 11:36:10 - ザンギ おおさんのご紹介のサイトですが．．． 初めて試しにやってみました（汗） ボックスにNCBIのAccession番号を入れて「GetPrimers」を押すだけで デザインしてくれますね。 走ってるプログラムはPrimer3っていう歴史の長い奴なので、方法として は新しくないですけど、NCBIでやってくれてしまうというのは、なんとも。 ちなみにcomplete cdsですが、completeなのは開始コドンと終始コドンが ちゃんと揃ってるという意味ですよね。 そういうところの情報はDDBJに日本語で説明されてますので、参考まで。 http://www.ddbj.nig.ac.jp/sub/ref10-j.html

(無題) 削除/引用 No.1747-2 - 2009/12/11 (金) 11:25:06 - おお cds; coding sequence ほとんどの場合は目で追いながらきめてましたが、 最近ここに設定したプライマーをほりこんで間違い がないかとか確認するようになりました。 デザインもやってくれるんかなぁここ. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/

遺伝子配列の検索について 削除/引用 No.1747-1 - 2009/12/11 (金) 11:04:10 - ship いつも大変お世話になっております。 遺伝子配列の検索についてお教えください。 遺伝子配列の検索をNCBIでして,シークエンスを行いたいのですが…。 mRNAとmRNA,complete cdsの二種類がありました。mRNAは2704bpで,mRNA,complete cdsは537bpでした。このmRNA,complete cdsこの違いについて教えてください。 あと,プライマーのことですが…。今回は初めてなので外注で設計してもらうかと考えておりますが,先生方はやはりOLIGOソフトなどを購入し自分で設計してもらっているのでしょうか？ お忙しいところ誠に申し訳ありませんが,ご教授の程宜しくお願いいたします。

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