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(無題) 削除/引用 No.1611-3 - 2009/11/25 (水) 17:54:30 - Kanata > ただ、リン酸化部位を同定するには、MALDI-TOF-MSしかReliableではないと思います。 多分混同なさっているのかと思いますが、 MALDIに限らず質量分析法（LC-MS/MS, LC-Q-TOF など各種）を用いて結果を示すのがreliableです。ただ質量分析法であっても限界はあり、すべてのリン酸化部位を同定できるわけではなく、PPPさんがお尋ねになっている方法やＷＢなどを含め、各種アプローチが必要になると理解しています。

(無題) 削除/引用 No.1611-2 - 2009/11/25 (水) 14:55:25 - TS レスがつきませんね。 例えば、こんなサイトもありますが。 http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhosK/ http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/ ただ、リン酸化部位を同定するには、MALDI-TOF-MSしかReliableではないと思います。部位を推測して、変異タンパク質を発現させて確認する方法もとれますが、以前に、この方法のみで、あるJournalに投稿したときには、MALDIで確かめろ、と言われて、結局やりました。。。

リン酸化部位の見つけ方 削除/引用 No.1611-1 - 2009/11/23 (月) 20:10:29 - PPP コンセンサス配列が分かっているPKCやPKAなどの蛋白質リン酸化酵素でリン酸化されると推測されるアミノ酸を見つけるために皆さんはどのようなツール・web siteをお使いですか？ また、配列中にどのようなモチーフがあるのか検索する場合にお使いのツール・web siteもお聞かせいただけると助かります。 宜しくお願いします。

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