Bio Technical フォーラム

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合成shRNAによるノックダウン トピック削除
No.1539-TOPIC - 2009/11/11 (水) 15:00:39 - KD
いつも拝見させていただいております.
非常に基本的な問題かもしれませんが,確信を持てないのでお教えいただければと考えております.

通常,shRNAはstem-loop構造を持つ1本鎖RNAをコードするベクターを細胞内に導入し,転写された一本鎖RNAがDicerの切断によりsiRNAが生じているかと思います.

そこで質問なのですが,人工的に合成したshRNAを細胞外から添加して導入した場合,一般的なsiRNAと同様にノックダウン効果を持つのでしょうか?

もちろんインターフェロン応答を引き起こしやすいといった点などデメリットが多いと思いますが,関連文献情報などもしお持ちの方がいらっしゃいましたら,お教え願えればとありがたいのですが.
(例えば,市販されているようなリポ脂質などにより導入できるかのか?配列上必要な特徴(siRNAですと2nt程度のover-hangが必要であるとか)など)
 
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合成shRNAによるノックダウン 削除/引用
No.1539-1 - 2009/11/11 (水) 15:00:39 - KD
いつも拝見させていただいております.
非常に基本的な問題かもしれませんが,確信を持てないのでお教えいただければと考えております.

通常,shRNAはstem-loop構造を持つ1本鎖RNAをコードするベクターを細胞内に導入し,転写された一本鎖RNAがDicerの切断によりsiRNAが生じているかと思います.

そこで質問なのですが,人工的に合成したshRNAを細胞外から添加して導入した場合,一般的なsiRNAと同様にノックダウン効果を持つのでしょうか?

もちろんインターフェロン応答を引き起こしやすいといった点などデメリットが多いと思いますが,関連文献情報などもしお持ちの方がいらっしゃいましたら,お教え願えればとありがたいのですが.
(例えば,市販されているようなリポ脂質などにより導入できるかのか?配列上必要な特徴(siRNAですと2nt程度のover-hangが必要であるとか)など)

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