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ブレンドされたdNTPの単位は? トピック削除
No.1525-TOPIC - 2009/11/10 (火) 06:29:11 - dNTP Blend?
いつもお世話になっています。

うちのラボでRT-PCRを行うときには、cDNA合成はINVITROGENのkitに添付の10mMdNTPをPCRはABIの100mMdNTP Blendを使っています。一見この2つの濃度は10倍異なるように見えますが、実際はINVITROGENのdNTPは "each at a concentration of 10 mM", ABIのdNTPは"25mM each of dATP, dCTP, dGTP, and dTTP"と記載されており、2.5倍の違いは2.5倍です。

最初から混合されているdNTPの場合このどちらの表記が正しいのでしょうか?

PCRに使うdNTP濃度として0.2mMと記載されている場合、わたしはこれを各々0.2mMとINVITROGENと同じようにに考えていたのですが、間違っているのでしょうか?
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.1525-4 - 2009/11/10 (火) 15:32:35 - dNTP+Blend?
日本語脳様
>英語の語感としてはABIの方の100mMはBlendに掛かっているように聞こえる>ので、Blendとしての濃度を表記しているのではないでしょうか。

なるほど、その通りです。よく理解できました。ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.1525-3 - 2009/11/10 (火) 11:19:12 - 日本語脳
Pumpkinさんの仰ることに尽きていると思いますが、英語の語感としてはABIの方の100mMはBlendに掛かっているように聞こえるので、Blendとしての濃度を表記しているのではないでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.1525-2 - 2009/11/10 (火) 11:10:59 - Pumpkin
>PCRに使うdNTP濃度として0.2mMと記載されている場合、わたしはこれを各々0.2mMとINVITROGENと同じようにに考えていた

解釈はそれでいいのではないでしょうか。

>最初から混合されているdNTPの場合このどちらの表記が正しいのでしょうか?

どちらも特に間違えはないのではないですか?どの場合においても溶液にはどのようなものが、どの組成であるかを確認してから使用する必要があることは言うまでもないことだと思います。勝手に解釈しないで、詳細を確認すればいいことです。トピ主さんも

>INVITROGENのdNTPは "each at a concentration of 10 mM", ABIのdNTPは"25mM each of dATP, dCTP, dGTP, and dTTP"と記載

と確認されているから問題ないですよね。これを100 mMと書いて有ったからといって使用して、2.5倍濃度が違ったと後から気付いたとなれば、実験準備の不備を指摘されても仕方ないかと思います。

ブレンドされたdNTPの単位は? 削除/引用
No.1525-1 - 2009/11/10 (火) 06:29:11 - dNTP Blend?
いつもお世話になっています。

うちのラボでRT-PCRを行うときには、cDNA合成はINVITROGENのkitに添付の10mMdNTPをPCRはABIの100mMdNTP Blendを使っています。一見この2つの濃度は10倍異なるように見えますが、実際はINVITROGENのdNTPは "each at a concentration of 10 mM", ABIのdNTPは"25mM each of dATP, dCTP, dGTP, and dTTP"と記載されており、2.5倍の違いは2.5倍です。

最初から混合されているdNTPの場合このどちらの表記が正しいのでしょうか?

PCRに使うdNTP濃度として0.2mMと記載されている場合、わたしはこれを各々0.2mMとINVITROGENと同じようにに考えていたのですが、間違っているのでしょうか?

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