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肝臓からのRNA抽出 トピック削除
No.1516-TOPIC - 2009/11/09 (月) 09:05:01 - すや
QIAGENのRNeasy Mini kitを用いて肝臓からRNAを抽出しているのですが、確実にRNAを取ることができません。(取れるときと取れないときの差が激しすぎます)

プロトコル通り取っているのですが、毎回肝臓のサンプルを取るときは取れたらラッキーくらいな思いで実験しています。肝臓の場合はグリコーゲンが多くてカラムでは取りにくい・・・と聞いたことはあるのですが、理由を知っている方がいれば教えていただけないでしょうか?
あと、気を付ける点があればこちらの方も教えてください。

よろしくお願いします。
 
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No.1516-7 - 2009/11/09 (月) 19:47:33 - すや
7878さん、pumpkinさんへ

組織量はいつも20mg前後で行っていますので、過剰量による影響はないと思います。lipid tissue mini kitは以前脂肪からRNAを取る時に使用していて、残りがありますので、早速その方法で試してみます。
アドバイスありがとうございます。

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No.1516-6 - 2009/11/09 (月) 18:05:46 - Pumpkin
私もLipid tissue mini kitを試してみることをお勧めしますね。7878さんのようにTrizolとRNeasy Mini kitを併用したことはありませんが、同様のプロトコルになるならためしてみる価値はあると思います。このキットは脳なんかからとるときに重宝します。

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No.1516-5 - 2009/11/09 (月) 18:00:11 - 7878
念のためですが,組織重量100mgがmini kitカラムの許容量だと思いますが,その点は問題ないですか?多すぎるとカラムが目詰まりして収量が落ちるそうです。

あと,Trizolでホモジナイズしてクロロホルム加えて,遠心後の上清にエタノールを加えた溶液をカラムに通せば,Lipid tissue mini kitと同じプロトコルです。私の経験では,これで肝臓からのRNA抽出に失敗したことはありません。

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No.1516-4 - 2009/11/09 (月) 11:41:05 - すや
7878さんへ
マウスの肝臓です。過去ログ、ありがとうございました。EtOHを70%→50%にしたのですが、それでも取れないことが多いです。

あ さんへ
アドバイスありがとうございます。あまりにもカラムを使うと取れないことが多すぎるので、次からtrizol試薬で抽出しようと考え中です。

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No.1516-3 - 2009/11/09 (月) 09:59:31 - あ
質問に対する答えではありませんが、カラムなんか使わずtrizolなどの抽出試薬でやれば普通に取れます。

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No.1516-2 - 2009/11/09 (月) 09:35:07 - 7878
マウスの肝臓ですか?それともラット?
ラットはグリコーゲンの影響で収量が落ちることがあるそうです。マウスでもrefeedingすると同じ状況になることもあるようです。
対策として70%エタノールではなく50%エタノールを使うと改善されることがあります。
過去ログも参考にされて下さい。
http://www.kenkyuu.net/cgi-biotech/biotechforum.cgi?start=1;mode=view;Code=4108

肝臓からのRNA抽出 削除/引用
No.1516-1 - 2009/11/09 (月) 09:05:01 - すや
QIAGENのRNeasy Mini kitを用いて肝臓からRNAを抽出しているのですが、確実にRNAを取ることができません。(取れるときと取れないときの差が激しすぎます)

プロトコル通り取っているのですが、毎回肝臓のサンプルを取るときは取れたらラッキーくらいな思いで実験しています。肝臓の場合はグリコーゲンが多くてカラムでは取りにくい・・・と聞いたことはあるのですが、理由を知っている方がいれば教えていただけないでしょうか?
あと、気を付ける点があればこちらの方も教えてください。

よろしくお願いします。

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