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タンパク質の発現部位を調べたい。
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No.1451-TOPIC - 2009/10/30 (金) 22:41:56 -
ナナエタ
あるタンパク質の発現量、どこで発現しているのか(どの臓器、細胞など)をネット上で調べたいと思っています。何か良いサイトがあれば教えてください。
human protein atlasで調べたところ、私の調べたいタンパク質は記載されていなく、悩んでいます。論文なども調べたのですが、Splicing variantの発現量などは載っていないため、探しています。
よろしくお願いします。
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No.1451-5 - 2009/11/02 (月) 10:09:19 - CJ
?さん
最近はそうでもないようですよ。mRNAの例ではallen brain atlasでは論文未記載の分子発現が山盛りです。ただ、信頼性、という面を考えると、実験を個々人がやり直すべきだとは思いますが。
(無題)
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No.1451-4 - 2009/10/31 (土) 18:41:26 - 名無し
このサイトに行って左上にあるQueryをクリックして、蛋白質名などを入力して検索すると、それに関する情報が出ます。インターラクションとか修飾とかに加えて、組織別の発現パタンとか各種培養細胞での発現とかの情報も得られます。さらに詳しいことは個別の文献で調べた方がいいとおもうけど当座どこで発現してるかみたいなことなら間に合うと思います。
http://www.hprd.org/query
(無題)
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No.1451-3 - 2009/10/31 (土) 11:24:25 - ?
論文でないのなら、ないんじゃないですか?
論文で記載されたデータが情報源のものばかりでしょ?
常識で考えて。
(無題)
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No.1451-2 - 2009/10/30 (金) 22:59:48 - 免疫組織以外にも
免疫組織以外にも調べられますので
http://refdic.rcai.riken.jp/welcome.cgi
タンパク質の発現部位を調べたい。
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No.1451-1 - 2009/10/30 (金) 22:41:56 -
ナナエタ
あるタンパク質の発現量、どこで発現しているのか(どの臓器、細胞など)をネット上で調べたいと思っています。何か良いサイトがあれば教えてください。
human protein atlasで調べたところ、私の調べたいタンパク質は記載されていなく、悩んでいます。論文なども調べたのですが、Splicing variantの発現量などは載っていないため、探しています。
よろしくお願いします。
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