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酸素無いのは辛い 削除/引用 No.1389-5 - 2009/11/01 (日) 22:57:04 - あべちゃん ajiさん、 ありがとうございます。やっぱりアミノ酸からケトグルタル酸は供給されるんですよね。 呼吸鎖の反応を見ているので、酸素無し条件は厳しいですね。 今、ミトコンを用いて電子伝達系を調べているのですが、別の方法を考えないと無理かも知れないです。 ある実験で呼吸鎖複合体２の阻害剤込みの実験でちょっと予想外の結果となっていて、阻害剤ではなくコハク酸不含の条件でどうなのか、知りたいと思ったのですが、TCAを止めたつもりでも、複合体２の活性が有るんですよね。 情報頂き、ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.1389-4 - 2009/11/01 (日) 17:28:12 - aji ~さんの挙げた例は2-oxoglutarate dioxygenasesと呼ばれる一群の酸化酵素でほとんどが酸素を使った水酸化酵素です。分子状酸素を２−オキソグルタル酸と目的の基質に酸素一個ずつくっつける酵素です。 ２−オキソグルタル酸からコハク酸が出来ます。２−オキソグルタル酸はTCA回路以外にアミノトランスフェラーゼからも供給されるのでアミノ酸由来と考えるのがシンプルです。 この反応停めるには酸素なしが一番ですが、、、。

Glnかぁ 削除/引用 No.1389-3 - 2009/10/23 (金) 10:58:35 - あべちゃん >[Re:2] ~さんは書きました : > KEGGだと、Alanine, Asparagine and Glutamine metabolismで、 > Glutamateから作られる経路はあるようです。 ~さん、 情報を頂きましてありがとうございます。 グルタミンの方から来るんですねぇ。全然知りませんでした。 TCA止めてコハク酸が無いと反応しないような条件でアッセイをしているのですが、どうも、漏れている感があって・・・培地中のグルタミンかなぁ。 どうもありがとうございます。

(無題) 削除/引用 No.1389-2 - 2009/10/22 (木) 15:20:27 - ~ KEGGだと、Alanine, Asparagine and Glutamine metabolismで、 Glutamateから作られる経路はあるようです。 Reactomeにあった、TCA回路の物質らしいものが出てこない、コハク酸が出来るヒトの反応 phytanoyl-CoA + 2-oxoglutarate + O2 => 2-hydroxyphytanoyl-CoA + succinate + CO2 (Homo sapiens) は役者がよく分かりませんが、TCAサイクル以外かもしれません。 ただ、TCAに対してどの位の量かなどは、マップや反応を見ただけなのでなんともいえませんが。

コハク酸 削除/引用 No.1389-1 - 2009/10/22 (木) 13:11:13 - あべちゃん 哺乳類細胞内でTCAサイクル以外でコハク酸が生合成される経路は存在するのでしょうか？ つまり スクシニルCoAから生成される経路と TCAの逆反応としてフマル酸から生成される経路です。 グリオキシル酸経路でもコハク酸が中間体として産生されるそうですが、哺乳類にはこの経路は無いようです。 ご教示願えませんでしょうか？

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